如果是单一囊肿，没有影响到肾脏功能，可以考虑暂时不进行外科手术治疗的，平时注意休息，其次就是定期复查看看囊肿是否有进行性长大的情况存在，如果继续长大，及早手术还是比较好的。对于囊肿目前还没有药物进行治疗，主要是外科手术或者是观察。
中药治疗没有效果。肾囊肿主要是由于先天发育形成的良性肿瘤，对身体不会造成不良影响，如果直径不超过五公分，也没有腰酸腰痛等不适症状的话，一般不需要特殊治疗，注意休息，避免劳累，定期复查，如果生长速度快，直径超过五公分或出现腰酸腰痛等压迫症状的话，可以考虑手术切除。
可以通过药物治疗，必要的时候可以采取手术切除，可以采取B超引导下肾囊肿穿刺进行缓解，一定要做好保暖措施，避免身体过于劳累，可以做彩超检查，明确囊肿的大小，位置，数量，来更好的检查，保持一个规律的作息时间。
肾囊肿的病因目前还不能完全确定，单纯性的肾囊肿，一般是肾小管憩室逐渐发展而来的，并且随着年龄的增长，患单纯性肾囊肿的风险会逐渐增加。左肾囊肿的最大的危害就是发展成恶性囊肿，进而发展为尿毒症。无痛而良性的肾囊肿不需要治疗，但如果囊肿变大、压迫肾脏正常组织，造成肾功能下降，或者如果发现囊肿是恶性的，出现疼痛，往往需要及时治疗。
肾囊肿的治疗方法是有很多的，可以通过口服药物治疗或者是手术治疗，是要通过病人的临床表现以及囊肿的大小来决定，如果肾囊肿有引起尿路感染或者是远端的尿路梗阻。就要去当地正规医院或者国家规定的三甲医院治疗。
治疗肾囊肿的方法以囊肿减压术为主，主要是针对于表浅而且比较大的囊肿，尤其是出现持续性疼痛且伴有严重的高血压、肾功能不全者。如果出现合并有囊肿感染者，需应用抗生素进行治疗。