肾囊肿的根本原因是肾虚，是脏器功能退化的症状。随年龄增长而出现，大多数单发，生长缓慢，不用特殊处理，但是对于直径大于5cm的肾囊肿需要治疗，以防压迫肾组织，现在都不做手术，而是做肾囊肿减压术。
肾囊肿是一种良性的。如果体积很小，通常没有明显的不适。建议病人进行肾彩色多普勒超声检查。如果囊肿体积较小，应该进行骨科检查以确定是否是由腰椎间盘突出或腰肌劳损引起的。如果囊肿的体积超过4厘米，可以通过手术切除。开放手术恢复时间约为一个月。
如果是单发的囊肿，是单纯性的囊肿，是个良性的病变，肾囊肿没有临床症状时不做什么治疗，放松心情，注意休息，饮食勿食辛辣刺激的食物，定期检查，平时生活中在饮食上也要多注意，不要食用过多的辛辣的刺激性食物。
肾囊肿是良性的病情，是不需要医治，但需要定期复查肾脏彩超，才能评估肾囊肿大小及有没有造成肾脏病情可能，如果定期复查肾囊肿增大，影响肾功能及腰部疼痛，就需要考虑手术医治。
双肾囊肿对于治疗，首先是测量囊肿的大小，以及有没有引起来相关的临床症状，比如肾脏压迫症状，腰痛，血尿等。肾囊肿是最常见的肾脏结构异常，属于后天形成的，大多不会超过两厘米，大部分都不会引起来临床症状，也对身体没有什么妨碍，不需要用药治疗每年定期复查就可以了。