肾囊肿大多数是先天性的，也就是说胎里带来的。只是在体检中偶然发现，一般无临床症状。定期复查是比较好的治疗方法。如果囊肿进一步扩大，导致肾功能下降，应积极手术治疗。
肾囊肿形成的主要原因是由于泌尿小管上皮出现梗阻，导致原尿在形成的过程当中逐渐潴留而形成肾囊肿。是由于先天性的因素而出现的，不会由于某些病理性因素决定肾囊肿的出现。
肾囊肿的形成因素是多方面的，对于单纯性肾囊肿主要是由于肾脏的集合管堵塞，造成尿液分泌受阻，从而逐渐的形成囊性的扩张，引起肾脏囊肿。还有一种多发性的肾脏囊肿，又称多囊肾，多囊肾于先天性遗传因素有关，属于常染色体遗传病。
肾囊肿是有很多发病原因，如果家人亲属有得肾囊肿疾病的，可能会出现基因突变，还有就是，感冒也会导致肾病患者肾脏损伤，肾囊肿是一种比较常见的良性病变，也有可能是身体的抵抗力比较低而造成疾病出现。
胎儿肾囊肿是先天性发育不良的原因造成的。
胎儿肾囊肿的病因与其他的肾囊性结构相似，都是由于一个组织的发展而引起的囊样变化，目前尚不明确。这种囊状的变化和我们的胚胎有很大的关系，但是具体是什么原因，我们也不知道，但是既然是囊状的变化，那就说明这是一个良性的结构，一般都会把注意力集中在胎儿肾囊肿的身上。
肾囊肿是有很多发病原因，如果家人亲属有得肾囊肿疾病的，可能会出现基因突变，还有就是，感冒也会导致肾病患者肾脏损伤，肾囊肿是一种比较常见的良性病变，也有可能是身体的抵抗力比较低而造成疾病出现。要提高自身免疫力。