慢性的肾盂肾炎，会导致肾盂肾盏的扩张而变形，从而会对患者的肾功能产生影响，会导致肾功能不全。但是总体上慢性肾盂肾炎的患者，肾脏的损害进展相对较慢，十几年或者几十年可能都不会进展到严重的终末肾脏病，因此存活时间也是较长的。
治慢性肾盂肾炎的方法为：蜡疗，用蜡袋或蜡饼敷于双肾区，温热作用可改善肾脏血液循环，并能增强药物的消炎作用。抗生素治疗，应选用血中浓度高的抗菌药，若能同时使用尿中浓度高的抗菌药以保持尿中无菌，即能更好的控制慢性肾盂肾炎的发展。
出现慢性肾盂肾炎的治疗方法是：一般治疗，去除发病因素，尤其是解除尿流不畅、尿路梗阻，纠正肾和尿路畸形，这样才能彻底有效治疗而不再发。超短波疗法，将两个板状电极置于肾区，即肋脊角与肋腰角之间的区域，前后对置，无至微热量。
出现慢性肾盂肾炎后的治疗办法有：病因治疗，先查明原因，再根据病因预防及治疗，若病情较轻，可按药敏选择用药，若病情较重，应用大剂量杀菌药治疗。紫外线疗法，对于反复发作的慢性肾盂肾炎无肾功能不全的病人，采用肾区紫外线照射，有一定的治疗作用。
治疗慢性肾盂肾炎的办法有：手术治疗，手术治疗肥大的前列腺，使尿路梗阻得以解除，就可以有效的治疗慢性肾盂肾炎。中药治疗，可服用中药，增强体质及抗感染能力，减少复发，保护肾功能，必要时可采取中西医结合，取长补短。
治慢性肾盂肾炎的办法有：病因治疗，首先应找寻不利因素，如尿路结石、畸形、尿道颈梗阻、前列腺炎、尿道内炎症病灶、膀胱输尿管返流等，并设法纠正。手术治疗，手术治疗肥大的前列腺，使尿路梗阻得以解除，就可以有效的治疗慢性肾盂肾炎。