治疗慢性肾盂肾炎比较好的方法有：病因治疗，先查明原因，再根据病因预防及治疗，若病情较轻，可按药敏选择用药，若病情较重，应用大剂量杀菌药治疗。手术治疗，手术治疗肥大的前列腺，使尿路梗阻得以解除，就可以有效的治疗慢性肾盂肾炎。
比较好的治疗慢性肾盂肾炎方法是：病因治疗，如果是感染所引起的就是要用敏感性的抗生素杀灭病菌，另外也可以使用中草药调节人体的内分泌系统。抗菌药物治疗，常需两类药物联合应用，药效无用时可选用敏感药物分2-4组，轮换应用，可防止再发，对重新感染引起再发的慢性肾盂肾炎更为有效。
对于慢性肾盂肾炎的治疗方法，寻找并去除导致慢性肾盂肾炎发病的易感因素，解除尿路梗阻，纠正尿路畸形，提高机体免疫功能。已有肾功能损害的要注意维持水的平衡。有高血压的要降压治疗。要多注意休息。
治疗慢性肾盂肾炎比较常用的方法有：病因治疗，先查明原因，再根据病因预防及治疗，若病情较轻，可按药敏选择用药，若病情较重，应用大剂量杀菌药治疗。中药治疗，可服用中药，增强体质及抗感染能力，减少复发，保护肾功能，必要时可采取中西医结合，取长补短。
慢性肾盂肾炎诊断费用1千-3千元左右。专业的肾病医院通常的费用就是要贵些的，如果是去到不同的城市，比如是一线城市的医院，消费就是要高一些。二线城市的医院，消费上就会有稍微低些的情况。
常见的治疗慢性肾盂肾炎方法为：蜡疗，用蜡袋或蜡饼敷于双肾区，温热作用可改善肾脏血液循环，并能增强药物的消炎作用。一般治疗，去除发病因素，尤其是解除尿流不畅、尿路梗阻，纠正肾和尿路畸形，这样才能彻底有效治疗而不再发。