GPH基因递进增强疗法，该方法针对病毒有极强极复杂生物基因链因此生殖感染易反复发作不容易痊愈的特点，从基因分子生物学角度破坏病毒的基因生物链达到治疗的目的；抗感染药物治疗，根据尿细菌培养、药物敏感试验结果选用有效的抗菌药物。
针灸疗法，适合脾肾两虚者，可选用脾俞、肾俞、足三里、中极、关元、命门等穴，用补法。消除易感因素疗法，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。
中医治疗，中医常采用益气，补肾，清热利湿并重的原则，邪正兼顾，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显；抗感染治疗，用些抗生素类、抗菌类的药，以达到控制症状，减少复发的目的。
去除易感因素治疗，避免长期使用抗生素或者免疫制剂，血糖控制不佳的糖尿病患者要及时调整血糖，存在梗阻的，要解除梗阻；针灸疗法，适合脾肾两虚者，可选用脾俞、肾俞、足三里、中极、关元、命门等穴，用补法。
中医治疗，中医常采用益气，清热利湿并重的原则，邪正兼顾，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显。静脉滴注，药液应避光缓慢地滴入，耐受性差者可酌减剂量;临床疗效差者可酌加剂量。
抗生素与化学药物联合应用，疗效较好，全身治疗应注意休息，补充足够液体。消除易感因素，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。