肌间静脉血栓是否能自愈需要根据患者的病情来判断。
肌间静脉血栓是一种下肢静脉血栓，也就是下肢静脉血栓的周边型，通常有三种类型，一种是中心型，常见的是髂骨静脉血栓，另一种是周边型，就是小腿肌肉之间的静脉血栓，还有就是这两种情况，都是混合型。按照病情不同，可以分成急性期和缓性期，急性期可以通过躺在病床上，抬起患肢，使用低分子肝素进行抗凝和抗血小板等药物，消融大多数的血栓，同时也可以缓解，如果是长期出现的肌肉间静脉血栓，那么就不太容易痊愈了。肌肉内的血栓形成的时间和长度因人而异，有的人七到十天，有的人则是十多天。
一般情况下，大隐静脉血栓自愈的可能性很低，具体内容如下：
大隐静脉栓塞是一种常见的浅层静脉血栓。这种情况下，一旦出现了血管内的血栓，很有可能会自行愈合，如果出现了症状，就会出现红肿、疼痛等症状，很有可能会引起肺部栓塞，从而导致患者的生命危险。大隐静脉血栓的治疗主要是通过口服丹参注射液、血栓通等活血化瘀的方法来治疗。另外还需要口服一些能促进血管的药物，例如：马栗籽萃取液，羟苯磺酸钙，地奥司明等。
下肢深静脉血栓不能自愈。人体有凝血系统、抗溶系统、纤溶系统，机体形成血栓时，已启动系统进行自我保护，但上述系统不能完全清除血栓。血栓在急性期2周内易溶解，2周后血栓将固定于血管壁，造成纤维化，不易清除。不能消除的血栓可造成血管不通畅，静脉压增高，形成血管曲张及慢性溃疡，产生严重后果。
小腿肌间静脉血栓多不能自愈的，结合当地医生的检查根据病情的程度，采取药物溶栓，或者微创手术治疗比较好。治疗期间注意休息不要过度走动，禁辛辣刺激食物，禁生冷食物等。根据病情恢复情况，定期到医院复查以便及时调整药物。
脾静脉血栓可以通过一般治疗、手术治疗等方法进行治疗。
1.一般治疗：作为肝硬化、门脉高压进行脾脏切除后，脾静脉出现的血栓，可以观察，不必特殊处理。
2.手术治疗：如果为肝硬化、门脉高压，引起的脾静脉回流受阻，局部血流减慢，常在脾静脉出现明显血栓。由于局部侧支循环广泛建立，进行门脉高压手术即可控制病情。