一般可采用药物治疗与康复治疗相结合。患者可在家中使用对症药物治疗，或者在家庭成员的帮助下，进行体育锻炼，针灸，按摩等，要注意饮食，如有必要，必须前往常规专科医院进行诊断治疗。
患者需要按医生的嘱咐口服调理神经功能方面的药物。在出现脑炎后遗症以后一定要对症治疗，并且坚持治疗和预防并发症，如果出现头痛比较严重的时候，就可以服用止痛药。
脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
可以采用药物治疗在相结合康复训练，要控制颅内高压、高热和抽搐发作尤为重要，精心护理可防止继发感染，注意饮食，生活要规律，也可去正规医院诊断后在配合医生治疗。
早期的脑炎后遗症是可以治疗的，但是预后还和病毒的分类是有关系的，比如病毒性脑炎的预后和病变的范围和病情的轻重有关，如果脑部病变比较局限，并且没有侵犯生命中枢，病情比较轻时预后比较良好。
孩子的这主要取决于后遗症的类型、严重程度以及治疗是否及时有效等。建议家属保持平和心态，克服急于求成心理，营造一个有利于孩子康复的宽松环境，同时到正规医院康复中心就诊，在专业康复师的指导下制定功能训练计划，持之以恒的进行锻炼，尽量减轻其伤残程度，提高生存质量。
