可以采用药物治疗在相结合康复训练，要控制颅内高压、高热和抽搐发作尤为重要，精心护理可防止继发感染，注意饮食，生活要规律，也可去正规医院诊断后在配合医生治疗。
早期的脑炎后遗症是可以治疗的，但是预后还和病毒的分类是有关系的，比如病毒性脑炎的预后和病变的范围和病情的轻重有关，如果脑部病变比较局限，并且没有侵犯生命中枢，病情比较轻时预后比较良好。
脑炎后遗症是不能治好的，早期也就只能改善病人的症状，通常就需要坚持锻炼，需要以中西医结合的方式防止病情的扩散。一般来说脑炎后遗症的伤害都是比较严重的，脑炎后遗症的不是很明显等到症状明显的时候已经给患者带来了严重的伤害，脑炎轻重差别很大。
脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为精神方面异常。有不同程度的肢体运动障碍、智力障碍、失语、眼球麻痹、吞咽困难等后遗症。随着病情的恶化，会导致压迫神经，出现了脑活动不正常的现象。
通常使用药物治疗和康复结合治疗，患者可以使用对症药物和训练进行治疗。其饮食应该清淡，也可以通过中医，针灸和按摩来治疗。需要更多的体育锻炼，生活应该是规律的。
患者需要按医生的嘱咐口服调理神经功能方面的药物。在出现脑炎后遗症以后一定要对症治疗，并且坚持治疗和预防并发症，如果出现头痛比较严重的时候，就可以服用止痛药。