不抽出腱鞘囊肿内的积液，不能直接打上封闭针，因为这样并不能消掉，还可可能会影响病情恢复。
在注射封闭针前，一般需要穿刺排出内腔内的积液，然后在局部注入糖皮质激素，这样就会引起囊肿的包膜粘连，阻止其包膜内的液体流出，造成腱鞘囊肿的再次出现。不过，如果想要彻底治愈，建议在医生指导下进行外科手术治疗。
对腱鞘囊肿多数病例无需特殊处理，由于腱鞘囊肿并没有造成明显症状，所以主动注意休息即可。
切忌局部反复按摩推拿，否则可能会导致腱鞘囊肿渐渐变大，造成疼痛症状时，特不必封闭针治疗。可通过手指将其挤出或手术取出。若做打封闭针治疗，麻醉时有一点疼，麻醉后也没有疼的感觉。打封闭针时要做好消毒处理，避免因为穿刺引起感染，在打针后要注意休息，避免打针处过多的活动。在打针后观察1周的时间，如仍有疼痛感，可进行第二针的注射。
腱鞘囊肿一般受压后不会消失。
但部分薄壁囊肿受压后可能破裂，暴露后囊肿变小，可能导致囊肿外观消失。如果按压后腱鞘囊肿消失，一般认为是腱鞘囊肿破裂，但这种情况下，腱鞘囊肿容易再次复发。一般来说，腱鞘囊肿推荐手术治疗，彻底切除囊肿更好。但需要注意的是如果患者病情较重，为顽固性的腱鞘囊肿，则不能采取揉按的方式治愈。如果揉按不当或用力挤破还有可能会对其他正常组织造成损伤，甚至增加感染风险。
如果腱鞘囊肿患者没有出现明显不适症状，可以不进行特殊的治疗。若出现不适症状或并发症时布不治疗，可能会导致病情加重。
腱鞘囊肿是一种良性的肿瘤，一般不会对人体产生任何的伤害，所以不需要特别的处理。但如果是大关节的腱鞘囊肿，会影响到关节的运动，尤其是扩张之后会压迫到神经血管，那么囊肿就需要进行特殊的治疗，将腱鞘囊肿去除，以消除压迫组织，恢复四肢的运动，缓解四肢的麻痹，改善四肢血液循环。
脚底腱鞘囊肿一般不会发生癌变，而足底这一部位的腱鞘炎和腱鞘囊肿属于一种常见的类型，一般预后都很好。
但是如果出现了长期的皮肤溃疡、坏疽或者是其他的皮肤病变，有可能发生癌变，大部分的腱鞘囊肿的预后都很好。在足底，如果出现腱鞘炎、腱鞘囊肿，会出现剧烈的疼痛、肿胀、活动受限等症状，早期的医疗措施可以很快得到改善，而且对以后的活动也没有什么影响。