如果腱鞘囊肿患者没有出现明显不适症状，可以不进行特殊的治疗。若出现不适症状或并发症时布不治疗，可能会导致病情加重。
腱鞘囊肿是一种良性的肿瘤，一般不会对人体产生任何的伤害，所以不需要特别的处理。但如果是大关节的腱鞘囊肿，会影响到关节的运动，尤其是扩张之后会压迫到神经血管，那么囊肿就需要进行特殊的治疗，将腱鞘囊肿去除，以消除压迫组织，恢复四肢的运动，缓解四肢的麻痹，改善四肢血液循环。
通常情况下，腱鞘囊肿中医可以通过使用药物、针刺治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：腱鞘囊肿中医治疗时，可以安静消炎镇痛膏、麝香止痛贴膏、云南白药膏等把膏药敷到患处，可以起到消肿化脓、活血行气的作用。
针刺治疗：腱鞘囊肿中医治疗时，根据囊肿的部位及症状，选择合适的穴位，可以很好的治疗腱鞘囊肿。
脚踝腱鞘囊肿可以通过针刺、药物治疗等方式改善。
脚踝腱鞘囊肿要根据囊肿的体积和局部的压力来决定，如果囊肿很小，直径小于2cm，可以采取保守疗法，比如在外用热敷，可以用针刺，进而可以对局部进行封闭，但是对于大的腱鞘囊肿，或是压迫到了周边的神经动脉，引起了足趾的麻木和痛苦。这时需要进行药物治疗，起到止痛的作用。
腱鞘囊肿的典型表现为腕部、足背部等局部皮下圆形或椭圆形囊性肿物，一般无痛。其病因和局部损伤或劳损有关。
腱鞘囊肿多发生于腕背部、腕掌部、足背部，也可见于手指关节等部位。局部皮下浅表部位出现圆形或椭圆形肿物。大小不一，多在0.5～2.5厘米。大小可以变化，反复使用该关节时通常会变大。主要采取穿刺抽吸-药物注射法、手术治疗、关节镜治疗等，能达到比较好的治疗效果。
一般情况下，脚腱鞘囊肿怎样治疗需根据实际情况来判断，具体内容如下：
如果脚腱鞘囊肿比较细小，没有疼痛、肿胀等症状，可以进行常规检查，无需特别处理；脚腱鞘囊肿还可以通过针灸、药物注入、拔罐、理疗等方式来进行，如果出现疼痛症状，可以服用布洛芬等抗炎症镇痛药物；但是若脚腱鞘囊肿大，对行走造成一定的阻碍，一般就可以采取手术。
腱鞘囊肿为手足高发病率浅表肿瘤，属良性肿瘤，通常无自主症状，长得较快时，会影响美观，还可引起局部神经压迫，产生有关病症。此病通常发生于儿童及青少年群体中，在临床上较为常见，但由于患者病情较重，手术风险较大，因此需要及时进行有效干预与处理。具体内容如下：
第1种可用手挤，但这种方法容易造成局部肿胀、疼痛和功能障碍。究其原因，就是尽管挤得粉碎，囊液断裂至组织间隙吸收，但腱鞘囊肿囊壁仍在组织内，故又可反复发作。
二是采用打封闭针处理，可使用注射器针头经穿刺手法穿刺，汲取清洁腱鞘囊肿囊液，接着注射激素，如强的松龙和得宝松，注射后加压包扎，应用激素粘连作用，囊壁间互相粘连，封闭。第三种为采用手术切除或者刮除病变组织来治疗本病。但仍存在相对高复发率，例如，复发率可能为20%-30%。