卵巢囊肿的处理原则是取决于囊肿的性质、大小及位置，如单纯囊肿，且不太大，通常不影响生育亦无需处理。恶性卵巢囊肿多采取输卵管卵巢切除术，将子宫与肿瘤连同盆腹膜整块切除。
胎儿卵巢囊肿属于一种病症，其病因至今尚未确定，至今还在进行中。有人主张该种疾病是由母体和胎儿两方面产生的促性腺激素作用所致，其治疗原则是以观测为基础。
如果不是特别的原因，可以选择做引产。一般都是正常的，不会对孩子今后的学习和生活造成一定的负面影响。确诊之后，需要考虑胎儿的状况，以及有没有严重的内脏异常等因素，然后再考虑是不是要怀孕。
通常情况下，卵巢囊肿是妇科的良性肿瘤。具体情况分析如下：
卵巢囊肿是指卵巢上有囊肿。可分为生理性囊肿和病理性囊肿。子宫内膜异位症是卵巢巧克力囊肿的常见原因。病理性卵巢囊肿是临床上确诊的，应尽早进行外科治疗，月经干净后3-7天到医院做白带化验，没有炎症就入院，同时要做好手术的准备，切除的囊肿要送到病理实验室进行病理检查。
一般来说卵巢囊肿属于卵巢肿瘤，是女性生殖器官一种常见肿瘤。可能会发于一侧，也可能发于双侧卵巢。卵巢囊肿主要症状表现为：1，白带、月经异常，有的患者表现为功能性子宫出血。2，身体多毛，比如上唇、小腹、胸部等部位部毛发增多。3，卵巢可能会增大。4，可能会不孕。5，可能会肥胖。如果卵巢囊肿小于五厘米，可遵医嘱服用金鸡胶囊、桂枝茯苓胶囊、止痛化癥胶囊等药物治疗。如果卵巢囊肿大于五厘米，可遵医嘱考虑选择宫腹腔镜微创手术。
首先是常规性治疗卵巢囊肿。病人从可以从调理自身的身体着手，积极参加运动，加快脂肪的燃烧分解、尽量避免高糖食物的摄入，合理控制体重。这些起床良好的习惯是可以帮助降低促使雄激素水平，对恢复排卵也能起到一定的帮助。