母乳性腹泻是由于母体内激素异常分泌，而引起母乳内的前列腺素成分增多，刺激新生儿或者是婴幼儿的肠道，从而造成肠蠕动增快，引起婴幼儿出现腹泻的症状。如果这类的新生儿或者是婴幼儿，在腹泻的同时，平时精神状态比较好，后期的体重增长相对正常，可不需要特殊处理的，在平时的时候注意观察。母乳性腹泻主要是常见于6个月以内，以母乳喂养为主的宝宝。
母乳性腹泻一般有以下几种原因。可能是宝宝对乳糖不耐受，体内缺乏乳糖酶。这样的宝宝可以少量多次食用，这样可减轻乳糖不耐受反应，每次的食用量不能超过250ml，也可改喂低乳糖牛奶或者米汤，能使宝宝乳糖不耐受的情况得到很大的缓解。可能是母乳中的前列腺素含量较高，该物质促进小肠平滑肌运动。妈妈饮食不健康引起的。
出现所谓生理母乳腹泻时，妈妈大可不必过于着急，不要为了大便成形而改喂牛奶，如果单纯为了形成大便，而改喂牛奶，反倒不利于孩子的吸收，容易造成营养不良，导致饥饿性腹泻，如果腹泻时间长则有可能导致生长停滞、营养不良等严重后果，需要及时治疗。
母乳腹泻的原因可能是小儿对乳糖不耐受，体内缺乏乳糖酶。乳糖不耐受分原发性和继发性两类，可用醋酸铅法测定患儿粪便中乳糖量以初筛，再用去乳糖饮食后迅速见效来证实。出现所谓生理母乳腹泻时，妈妈大可不必过于着急，不要为了大便成形而改喂牛奶，如果单纯为了形成大便，而改喂牛奶，反倒不利于孩子的吸收，容易造成营养不良，导致饥饿性腹泻。
宝宝母乳性腹泻可能会持续6个月左右。
6个月后可以添加辅食，之后母乳性腹泻的症状会逐渐改善，直到完全康复。母乳性腹泻要注意宝宝身体状况，此时最好少吃母乳，多吃配方奶粉。6个月以内母乳喂养为主的宝宝常见母乳性腹泻，主要的症状是大便的次数增多，通常一天在6次内，大便性状呈黄色、绿色，或者是呈少量泡沫样。