母乳性腹泻是由于母体内激素异常分泌，而引起母乳内的前列腺素成分增多，刺激新生儿或者是婴幼儿的肠道，从而造成肠蠕动增快，引起婴幼儿出现腹泻的症状。如果这类的新生儿或者是婴幼儿，在腹泻的同时，平时精神状态比较好，后期的体重增长相对正常，可不需要特殊处理的，在平时的时候注意观察。母乳性腹泻主要是常见于6个月以内，以母乳喂养为主的宝宝。
宝宝母乳性腹泻，也属于是宝宝的生理性腹泻。因为宝宝月龄小，所以消化系统、神经系统发育不完全，消化能力较弱，经常会出现消化不良、腹泻的症状，大多是由于宝宝对母乳当中的乳糖不耐受所引起的，一般一岁左右就会自愈。添加辅食之后，大便就会逐渐转为正常的。
母乳性腹泻一般有以下几种原因。可能是宝宝对乳糖不耐受，体内缺乏乳糖酶。这样的宝宝可以少量多次食用，这样可减轻乳糖不耐受反应，每次的食用量不能超过250ml，也可改喂低乳糖牛奶或者米汤，能使宝宝乳糖不耐受的情况得到很大的缓解。可能是母乳中的前列腺素含量较高，该物质促进小肠平滑肌运动。妈妈饮食不健康引起的。
出现所谓生理母乳腹泻时，妈妈大可不必过于着急，不要为了大便成形而改喂牛奶，如果单纯为了形成大便，而改喂牛奶，反倒不利于孩子的吸收，容易造成营养不良，导致饥饿性腹泻，如果腹泻时间长则有可能导致生长停滞、营养不良等严重后果，需要及时治疗。
如果孩子腹泻程度一般，无其他症状，精神活泼，食欲良好，虽腹泻病程较长，但是体重在不断增加。无需特殊治疗，可以继续母乳喂养的，如果腹泻严重的话可以吃点止泻药物调理一下，同时可改用不含乳糖的奶粉。和母乳混合喂养，一般添加辅食以后会好转的。