小儿膎窝囊肿的治疗与成人不同。孩子们经常不与关节沟通，很少有关节内损伤，这通常可以治好自己。成人经常有关节内损伤。手术切除囊肿应同时治疗关节内病变，否则易复发。原则上，所有的腘窝都应该切除。术前应行关节镜检查。其中大部分可以通过后内侧或后外侧切口进行。
膎窝囊肿一般在临床上药物保守治疗效果不佳，未经治疗的情况下这种囊肿一般不会消失，在临床医学上指的是膝关节后部的腘窝囊肿。还可以进行适当的针灸治疗，如果没有特殊症状的时候可以不进行治疗。
在临床上是非常常见的，如果没有什么不舒服的症状，是不需要特殊的治疗的，主要就是积极的注意休息，避免长时间的剧烈运动，如果有一些膝关节的滑膜炎骨性关节炎需要积极的进行治疗，否则关节积液增多容易导致囊肿的增大。如果局部囊肿增大明显，产生的局部明显肿胀的感觉，影响到关节活动受限，是需要积极进行手术治疗的，需要进行手术切除。
脑囊肿是一种先天性的病变，一般不会发生恶变，当囊肿在很小的时候，几乎没有什么症状，一般是在颅脑CT的检查中发现的，是不需要处理的，只需动态观察，定期复查即可。当囊肿增大到一定程度，引起脑组织的压迫症状，如引起颅内压增高，继发癫痫等情况时，需要治疗。
腘窝囊肿跟过度劳累或局部肌腱肌肉等软组织炎症有关，中医方面用中医辨证论治，对证治疗，如用活血化瘀，健脾利湿，消肿止痛的方药，外用舒筋活血的药物外敷会有所好转。
这种疾病一般来讲不会引起局部明显的症状，这种疾病的形成主要是由于膝关节的积液比较多关节腔内的压力比较大向后挤压形成的。形成一个良性的肿块。积极的多注意休息，热敷烫洗，就能够使关节积液得到充分的吸收，囊肿就会逐渐的变小。如果囊肿逐渐增大，引起了膝关节的活动功能受限，甚至压迫到了血管神经，是需要积极的进行手术切除的。
