在手术过程中，由于是使用全身麻醉，所以是没有什么感觉的，手术之后会有轻微的疼痛，一般都能够忍受。腹腔镜下的卵巢囊肿切除术是一种微创的手术方式，比以前所使用的经腹卵巢囊肿切除的创伤要小很多，而且术后恢复的也要快一些。
一般来说，做腹腔镜手术可能会痛。
因为腹壁神经比较敏感，所以开腹手术的时候会有比较强烈的疼痛，患者需要服用止痛药，而且腹腔镜手术还很容易出现下肢血栓、褥疮、肺部感染等并发症。腹腔镜是一种微创的外科技术，术后创伤小，疼痛较轻，术后第二天即可自由活动，患者可以多走动，可减少下肢血栓、褥疮、肺部感染等并发症发烧，对恢复有很大的帮助。
腹腔镜手术术中是不痛的，因为是全麻，没有知觉。术后会有疼痛不适，比传统手术要轻的多，疼痛的感觉主要跟手术范围，手术切口的大小，切口的多少，还有个人对疼痛的耐受有关系。术后可能会有喉咙不适感，可自行恢复。
腹腔镜手术后伤口痛可能是术后感染、伤口撕裂等原因导致的。
一般地说，大部分普通外科的手术，腹腔镜手术都能完成，如阑尾切除术，胃、十二指肠溃疡穿孔修补术、疝气修补术、结肠切除术、脾切除术、肾上腺切除术，还有卵巢囊肿摘除、宫外孕、子宫切除等，而如果腹腔镜手术后伤口痛，可能是术后感染、伤口撕裂等原因导致的。，建议注意去医院检查，然后使用抗生素进行治疗。
腹腔镜术后痛经可能与腹腔镜关系不大的，痛经的原因是由于子宫内膜合成的前列腺素过高，引起子宫异常收缩而发生的。可以去医院检查子宫及其附件超声，明确原因，对症治疗，平时热敷保持身体暖和，避免受寒及经期感冒。
可以给予止痛类药物进行止痛，腹腔镜手术后，比如腹腔镜下胆囊切除术、腹腔镜下阑尾切除术以及腹腔镜下腹股沟疝修补术等，出现肩膀疼痛不适，考虑与术中应用二氧化碳，吸收入血引起。