良性的卵巢肿瘤直径小于5cm，可观察数月，若有增大且实性，应手术治疗。可以通过仔细检查对侧，切除患侧附件，剥除肿瘤，保留卵巢组织以及生育功能。切除的卵巢肿瘤应立即剖开探查，必要时做冰冻切片检查。
卵巢蒂扭转是妇科急腹症之一，通常有卵巢囊肿病史，突发腹痛，可能合并恶心呕吐。B超检查附件区包块较前有明显的增大，血流不明显。需要急诊行手术探查。术中可以根据者的以及扭转后附件的血流情况决定手术方式，是良性瘤的。
中医治疗卵巢瘤可以用三联平衡疗法。中医可以用软坚散结，温中散寒，扶正祛邪等原理来改善症状，增效减毒，提高病人的生活质量。平时多吃一些对卵巢有利的食物，不要吃油炸和过于油腻的食物。
手术治疗，恶性者还需定期化疗，化疗是晚期卵巢癌的主要治疗措施。良性肿瘤的手术方式包括附件切除、子宫双附件切除术；恶性肿瘤的手术方式分为全面分期手术、保留生育机能的分期手术、肿瘤细胞减灭术。
一般情况下，卵巢囊肿可以通过活检来确认囊肿是否为良性，具体内容如下：
卵巢囊肿是良性还是恶性，通常要到医院做妇科肿瘤标记，如果是良性的，那就是有一定的几率。正常情况下，有恶性的可能性，比如血液ca125升高，或者是子宫内的巧克力囊肿，属于良性的。因此，要做好术前做一次简单的组织学分析，确定卵巢囊肿的具体情况，做简单的病理检查是不准确的。
通常情况下，良性卵巢囊肿可以通过手术来治疗。具体分析如下：
卵巢囊肿是卵巢常见的良性肿瘤，由于卵巢囊肿不会具有恶变的可能，因此，临床上对于没有临床症状卵巢囊肿可以不给予任何处理，单纯给予临床观察即可，常规进行超声检查，妇科检查和化验肿瘤标志物CA-125检查即可。但是，对于卵巢囊肿较大，伴有压迫、阻塞周围组织器官功能的，或者因为卵巢囊肿可能导致蒂扭转危险的患者，则建议手术治疗。