卵巢巧克力囊肿治疗费用在2000元-4000元。巧克力囊肿就是子宫内膜异位症引起的，对于巧克力囊肿的治疗，包括药物治疗和手术治疗，除了进行治疗的手术以外，其他的治疗方式都是有可能会复发的。巧克力囊肿的治疗费用，根据所处地区消费水平不同，就诊医院的级别和性质不同。
卵巢巧克力囊肿做手术的费用是7000元-10000元。一般手术的价格与很多因素有院系：治疗的方法、医院的定价、医疗设备等。包括，术前检查费用、手术治疗费用、术后消炎费用等。现在治疗巧克力囊肿的方法主要有：药物治疗、传统开腹手术、宫腹腔镜手术治疗。
是由于子宫内膜异位症导致的，是因为一位的子宫内膜随着月经周期发生周期性出血，但是血液无法正常排出，所以局部会出现肿大和疼痛，囊肿内的血液因为长期不能排出呈巧克力状。巧克力囊肿一般选择的是腹腔镜手术切除，属于微创手术，术后身体恢复较快，费用一般在两千左右。
卵巢巧克力囊肿微创手术费用在15000块钱左右。包括从住院到出院的费用，不包括术后出院复查的费用。医院的级别不同，收费标准是不一样的，比如二甲医院和三甲医院同样的微创手术，三甲医院会稍微贵一些，二甲医院会便宜一些。
巧克力囊肿手术可以选择开腹及腹腔镜两种。如果是开腹手术需要5千元-6千元；如果是选择微创手术腹腔镜，费用要高些7千元-9千元；因为巧克力囊肿的特殊性，术后是需要服用药物或是打针防止复发的。根据做的方法不同费用5千元-8千元；术后需要应用防止复发的药物。
5千元-1万元之间，巧克力囊肿是非常多见的妇科疾病，是子宫内膜异位症的一种，一般治疗的不一样，选择医院收费标准的差异，以及患病情况的差异，都会影响到最终的治疗费用。