多囊卵巢综合症是内分泌疾病，手术不能治好的，可以采用中医中药治疗，多囊卵巢综合症与肾气不足，气血亏虚，冲任失调，脾虚失运等因素有关，使卵巢功能失去了肾气及气血的滋养。
多囊卵巢综合症可以进行手术治疗。手术治疗有两种方法，对于黄体生成素和睾酮水平高的病人可以进行腹腔镜下卵巢打孔术，优点是疗效确切、损伤小、价格适中等；腹腔镜下卵巢打孔术可能出现的问题有治疗无效、盆腔粘连及卵巢功能低下。以前常用卵巢楔形切除术，可以降低雄激素水平、减轻多毛症状。
多囊卵巢手术切除卵巢，轻度可以保守治疗：物理治疗结合药物调节内分泌，活血化瘀、益肾填精、疏肝理气、化痰通经等途径进行治疗，以调节紊乱的月经，恢复正常的卵巢功能等。
多囊卵巢胎停的风险要高于正常情况下的胎儿。
这与胰岛素抵抗、高雄、内分泌失调等因素密切相关。这种情况下，孕妇要做好长时间的监护，最起码要监测3个多月，看看是否存在胎儿停止的危险。下腹部有轻微的疼痛或是有轻微的流血现象，需要及时到专业的医院进行全面的检查，由医生进行保胎。由于存在着胎儿停止的风险，所以多囊卵巢的发病率要高于普通人，出现2-3次以上的多囊卵巢导致的胎停育，要及时到正规的医院进行调理，由于卵子的生长周期一般是3个月，最好是怀孕前2-3个月，之后才能怀孕，这样孩子会比较好，出现胎停的可能性也会小一些。
多囊卵巢综合征病人出现阴道不规则出血、月经淋漓不断等异常时，应及时到医院进行检查。另外，由于患有多囊卵巢综合征的女性多伴有不同程度的胰岛素抵抗、雄激素水平偏高、代谢紊乱、肥胖等，很容易诱发Ⅱ型糖尿病的产生。