检查发现3.9cm×3.6cm的卵巢囊肿，要根据检查时间确定囊肿性质。
若在月经结束时发现的卵巢囊肿，病理性或生理性的都有可能。建议在下次月经干净后的3-7天复查B超，若包块还在，可能是病理性囊肿，需要定期密切随访或立即处理。若包块消失，则是生理性囊肿，则不用处理。若B超检查结果显示是囊性囊肿，肿瘤标志物指标正常，囊肿没有明显的血流信号，建议咨询医生了解具体情况。
卵巢囊肿是黄体囊肿，属于正常生理现象。卵巢在排卵后形成黄体，正常成熟黄体直径2～3cm，是囊性结构，可使卵巢略增大。若囊性黄体持续存在或增长，黄体腔内有大量的积液，使腔的直径超过3cm以上者则称卵巢黄体囊肿。卵巢黄体囊肿可由于某种原因引起囊肿破损、出血，严重者可引起急腹症，出现腹痛及阴道流血，而与异位妊娠破裂极为相似。
卵巢囊肿内见分隔，即是卵巢囊肿。卵巢囊肿是育龄期妇女常见的一种疾病，囊肿可以是生理性的或病理性的，生理性的囊肿无需手术，而病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。首先去医院在复查B超，明确是生理性的还是病理性的囊肿。彩色B超、X线检查、腹腔镜等先进诊断技术对卵巢囊肿病变可以早期诊断。卵巢囊肿虽然容易恶变，但只要做到早检查、早发现、早治疗还是可以避免的。
卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即：单一型或混合型，一侧性或双侧性，囊性或实质性，良性或恶性，其中以囊性多见。一般手术治疗可以剥除囊壁，介入疗法创伤小，但是有一定的复发率。目前不用太担心，调整好心情，生活规律一些，增强营养。
卵巢囊肿系数低只是代表着系数的变化，和激素水平变化因素有关系，不代表疾病的出现，要定期复查，可以结合具体的彩超变化情况来判断目前的一些变化，然后再进行判断。如果有炎症需要立即治疗。
卵巢囊肿内液清是卵巢内有囊性肿物生长，随着囊肿的增大，会造成局部囊肿发生增大的趋势，囊肿有生理性囊肿和病理性囊肿的区分。病理性囊肿是，由于体内激素异常而引起的。