最主要原因是遗传因素造成的胚胎异常，这种不正常发育的胎儿，如果足月产下，也会出现畸形或异常，除此之外，脐带供氧不足、羊水疾病等也是导致先兆流产的原因之一，如果孕妇孕期情绪不稳或者是营养不良也会造成导致流产。
孕妇的感染病、高烧、严重贫血、严重营养不良、放射性、有毒物质接触和生殖道畸形如双子宫、子宫肌瘤等易导致先兆流产。引起先兆流产的原因是比较多的，比较常见的是因为在怀孕早期孕妇体内孕酮低引起的。另一个比较常见的原因就是因为胚胎发育不良导致的自然淘汰。
先兆流产发生的病因主要有，染色体异常，染色体异常是流产的主要原因，染色体异常包括数量异常及结构异常两大类。又或者是母体原因，包括全身性疾病，全身感染时高热，可诱发子宫收缩，引起流产，还有一些已知的病原体感染，孕妇心衰、严重贫血、高血压、慢性肾炎及营养不良，均可导致先兆流产。
导致先兆流产的原因很多，如果准妈妈患有子宫畸形、妇科炎症、传染性疾病、严重贫血、心衰、高血压、糖尿病等疾病都会出现先兆流产首先应调理好自己的身体再考虑怀孕。这些病症对胚胎的发育有着直接的影响务必引起重视，避免因此导致流产早产的出现。
遗传基因缺陷，染色体数目异常。外界不良因素的影响，如放射线、病毒、乙烯雌酚等。胚胎方面：父体或母体生殖细胞不健全是主要原因，不健全的生殖细胞虽然勉强结合起来成为胚胎，但终会早期死亡，无法“瓜熟蒂落”，足月分娩。
一般引起先兆流产的原因还是比较多的，比如胚胎自身的原因，胚胎不健康，还有就是孕铜不足就会导致先兆流产的情况。所以不要有太大的精力负担在平时只要多注意休息，注意保暖，避免着凉，另外在下次怀孕的时候可以到医院去进行用前检查。
