这种疾病会导致月经失调，阴道不规则出血，月经量少，少数情况甚至月经会消失；另外，子宫内膜薄也说明体内雌激素偏低，卵子不能很好地着床，影响受孕，流产的可能性增大。
子宫内膜薄的严重症状有会出现月经的周期时间长，经期短，经量少，闭经，不容易怀孕，怀孕后容易流产。建议来月经的前3天去医院妇科检查彩超看子宫内膜厚度。如果子宫内膜厚度小于0.8cm以下就考虑子宫内膜偏薄。
子宫内膜太薄症状表现为子宫内膜粘连，血行不畅而量少，色紫黑有块，小腹刺痛拒按。常见的症状有行经期短、经量极少、甚或点滴即净、色淡红、兼有头晕耳鸣、腰酸腿软、足跟痛等症状。子宫内膜太薄会严重导致卵细胞无法正常的着床。
主要是导致月经量少，少数的会使病人的月经消失，所以，病人一定要及时治疗，否则也是可能会影响生育的，子宫内膜偏薄可导致卵子不能很好地着床，从而不能顺利受孕。雌激素不能达到一定的水平，做超声发现内膜厚度不到8毫米。
一般初潮龄较迟或初潮后经量过少，第二性征出现较迟，月经后雌激素分泌不足，常见的症状有行经期短、经量极少、甚或点滴即净、色淡红、兼有头晕耳鸣、腰酸腿软、足跟痛等症状。适量的雌激素、孕激素可以在一定程度上增加子宫内膜的厚度，改善子宫内膜薄的症状；多次药流，或者人流动作过重都可能引起子宫内膜薄；子宫发育畸形也是子宫内膜薄的一个原因，但长期以来一直别人们忽略。
妇产科经常性的宫腔操作本身就可能损伤子宫内膜，操作不当可能造成永久性不可逆的内膜伤害，有人工流产史，人工流产手术不当，子宫内膜搔刮过度、人工流产后继发感染均可能导致子宫内膜永久性损伤，形成日后的薄型内膜。急性或慢性宫腔感染均可导致子宫内膜基层的破坏。