多囊卵巢综合征要是经过药物治疗效果不明显，绝大多数还可以选择手术来治疗。如果是为了生育要求，可以选择多囊卵巢打孔手术来促排卵，达到生育的要求。如果多囊卵巢打孔效果不明显，可以做多囊卵巢楔形切除术。
多囊卵巢首先确诊后行性腺六项，胰岛素扺抗等检查，如果有高雄血症，应使用药物治疗。如果有胰岛素抵抗可以改善胰岛素抵抗，和高雄激素血症。对于肥胖者，还应加强锻炼，饮食控制，服用降代谢的减肥药，以减轻体重，可以帮助恢复排卵。必要时还可以通过手术卵巢打孔治疗。
多囊卵巢的治疗方法比较多，调理内分泌，增强子宫卵巢功能进行排卵，或通过腹腔镜技术针对多囊卵巢治疗或进行人工卵巢技术治疗等病情康复以后，能排出优势卵泡，就可以考虑怀孕生育。
多囊卵巢治疗是一个需要时间和耐心的过程，像肥胖型内分泌失调的，首先需要减肥，其次配合药物治疗，恢复受孕功能的概率还是很大的。如果是其他疾病导致的多囊卵巢，应先治好其他疾病，再做后续多囊卵巢的治疗，去不孕不育专科医院检查治疗。
多囊卵巢多吃豆类，五谷杂粮米饭，饮食宜清淡，并富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜食用刺激性、海产品等。适宜食物：牛奶、菠菜、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生等。
多囊卵巢综合症治疗方法主要有药物治疗和手术治疗2种，药物治疗方式主要的疗法如抗雄激素治疗及促排卵治疗。如果治疗效果不佳可以进行腹腔镜手术治疗。中医疗法对多囊卵巢综合症也有一定的治疗作用。
