如果患有念珠菌性阴道炎应该使用药物治疗。
建议患者首先在阴道内放置制霉菌素阴道片，这种药物有很好的抑制念珠菌感染的效果，也可以选择保妇康栓，这种药物属于中成药制剂，能够抑制真菌感染。在治疗期间要让患者保持阴部清洁，避免发生性生活，避免吃辛辣刺激性的食物，否则很可能会诱发反复感染的，也可以口服一些抗真菌的药物，例如口服酮康唑等等。
霉菌性阴道炎总是治疗不彻底时，会并发常伴有外阴烧灼感、疼痛、性交痛等。继发化脓菌感染可有脓性白带。阴道粘膜炎性感染可有血性白带及粘膜浅表溃疡。继发泌尿系感染时则会有尿频、尿急、尿痛等症状。合理应用抗生素及激素类药物，有糖尿病者应积极治疗原发病。因霉菌在碱性环境中不易生长。
念珠菌性阴道炎，又称阴道假丝酵母菌病，主要分为单纯型念珠菌性阴道炎，主要外用药物治疗，放置相关药物栓或者相关药物阴道栓，清洗外阴放入阴道内，此外要保持外阴清洁用药的时候禁止同房，复发型念珠菌性阴道炎，一般是连用三个月，每个月重复阴道放置相关药物栓一个星期后停药等下次来月经的干净三天再次放置相关药物栓，三个月后，来月经干净三天后复查白带常规，连续两次阴性为治好。
用碱性溶液如2~4%碳酸氢钠或肥皂水冲洗外阴及阴道，改变阴道酸碱度，使不利于霉菌生长，冲洗后，再用制霉菌素片剂或栓剂塞入阴道内，每次10万~20万单位，每晚一次，10~14天为一疗程，外阴再涂以3%的消炎药，效果可更好。
念珠菌性阴道炎治疗可以中西一起，效果会更好。念珠菌性阴道炎在临床上较为多见，复发率高，西医的药物治疗一般短期疗效较好，能很好地改善临床症状，保持心情舒畅，做到乐观豁达，及时排解自己的不良情绪。
治疗期间禁性生活，内裤毛巾煮沸消毒，服药期间忌酒，滴虫转阴后，每次月经净后复查白带，霉菌性阴道炎由霉菌感染引起。医学上把霉菌感染称为是念珠菌的感染，因此霉菌性阴道炎也称念珠菌性阴道炎。