引起排卵障碍的原因包括内分泌失调；情致因素；过度减肥；药物影响等因素。不排卵的原因主要是内分泌失调，卵巢有卵泡发育，但发育不成优势卵泡，也不排卵，所以发生不孕。
排卵障碍的原因有：黄体机能不全，黄体是卵泡发育成熟后排出卵子转变而成，黄体不好通常是因为其前身“卵泡”也发育不好，卵泡育不好，一直到排卵前卵泡内颗粒细胞数量不够，均可造成不孕；卵巢功能障碍，卵泡发育到一定程度，如果缺少关键性的激素，就好象是排卵动作中临门一脚，所以无法排卵；全身性疾病导致排卵障碍，重度营养不良、过度肥胖或饮食中缺乏某些维生素，都会影响卵巢功能；重症糖尿病等也能影响卵巢功能导致不孕。
引发排卵障碍的因素：严重营养不良、肥胖或饮食中缺乏某些维生素，可影响卵巢功能；内分泌和代谢疾病如甲状腺机能亢进或甲状腺功能减退，肾上腺皮质功能亢进或功能减退以及严重的糖尿病也会影响卵巢功能，不孕。
导致排卵障碍的常见疾病包括垂体泌乳素瘤、高泌乳素血症和赫施综合征。排卵障碍也是卵巢早衰引起的原因之一。卵巢早衰，是指卵巢卵泡已被耗尽，无法促进排卵，卵泡发育，最终会出现女性无法妊娠。
排卵障碍主要是指的不排卵，内分泌失调，就可能出现不排卵，患有多囊卵巢综合症的病人，或者是重度的糖尿病的病人，或者甲状腺功能异常的，甲亢的，或者甲状腺减退的病人都可能会引起不排卵。
女性排卵障碍可能是下丘脑垂体卵巢轴的功能紊乱导致，并且垂体肿瘤也会引起女性卵巢功能失调而导致不孕的发生。严重的缺乏营养、过度肥胖或是饮食中缺乏某些维生素也可能会影响卵巢的功能。