根据闭经的病因及其病理、生理机制，采用有针对性的内分泌药物治疗，以纠正体内紊乱的激素水平，从而达到治疗目的。如对CAH病人应采用糖皮质激素长期治疗；对有明显高雄激素血症体征的PCOS病人，可采用雌、孕激素联合的口服避孕药治疗；对合并胰岛素抵抗的PCOS病人。可选用胰岛素增敏剂治疗。以上治疗可使病人恢复月经，部分病人可恢复排卵。
药物治疗：由内分泌紊乱造成的闭经，如卵巢早衰、席汉氏综合征、多囊卵巢综合征等，可通过给予患者周期性的相关药物进行治疗；手术治疗：由宫腔粘连、宫颈粘连、宫颈闭锁、子宫内膜过薄等原因造成的闭经，需进行手术治疗，也可使用妇科电刺激法进行治疗。
月经持续6个月以上时应当治疗。治疗原则是诱发排卵，对大多数病例有效，能够恢复排卵。对乳漏并发闭经者可给溴隐亭。人绒毛膜促性腺激素疗法在治疗均不见效的话，也可试用，但应注意避免过剩刺激综合征的发生。本征在治疗前一般主张先行孕酮试验，观察有无撤退出血，此外尚须做肾上腺皮质功能检查，甲状腺功能检查，Gn-RH兴奋试验并测定血中卵泡刺激素、黄体生成素及雌激素，以掌握病情和治疗。
手术治疗闭经：对垂体瘤、卵巢肿瘤、肾上腺肿瘤等作手术切除生殖道有畸形者作矫正术、但手术治疗风险性高、恢复慢、感染率高。去除诱因治疗闭经：如消除紧张因素、合理安排工作生活、增强营养。促性腺激素治疗闭经。
毕竟治疗方法：对引起闭经的器质性病变进行治疗对宫腔粘连者可扩张宫腔，分离粘连，放置宫内节育器以防重新粘连，并使用雌、孕激素以促进子宫内膜增生和剥落。对卵巢或垂体肿瘤，在确诊后可进行手术治疗。对生殖道结核，给予抗痨治疗。