巧克力囊肿在饮食上需要注意忌口含有植物性雌性激素和动物性雌性激素的食物，比如蜂王浆、雪蛤、蜂蜜、豆浆、黑豆、花生酱、红酒、洋葱，在不同程度上都含有一定量的雌性激素。
巧克力囊肿不要吃含有植物性雌性激素和动物性雌性激素的食物，比如蜂王浆、雪蛤、蜂蜜、豆浆、黑豆、花生酱、红酒、洋葱等。临床上治疗的方法有服用药物保守治疗和手术治疗。具体选择哪种治疗方法与病人年龄，有无生育要求，盆腔黏连程度等有关系。
有卵巢巧克力囊肿需要忌葱、蒜、椒、桂皮等刺激性食物，忌肥腻、油煎、霉变、腌制食物。忌羊肉、狗肉、韭菜、胡椒等温热动血食物。避免高度紧张及精神刺激，保持乐观情绪及充足睡眠。
腹部手术后不同程度都有粘连，饮食清淡低盐易消化，避免难以消化的食物及刺激性食物饮料等，避免暴饮暴食。要加强营养，注意禁止辛辣的情况，配合多食新鲜的水果蔬菜较好，观察平时的月经情况是否正常，同时建议定期配合复查彩超情况较好的，注意休息。
一般所说的生理囊肿多指，黄体囊肿，或者黄素囊肿，或者滤泡囊肿，多为女性一个月的生理变化过程，由生理变化所引起的，例如黄体囊肿，则是在排卵后，黄体峰值期，因黄体素持续分泌，从而形成潴留囊肿，但随着月经的来潮，下次月经的开始，黄体峰值期的衰退而消失或者缩小。
应该多吃抗囊肿的食物，鲎，海马，龙珠茶，山楂，囊肿出血的应该多吃羊血，螺狮，淡菜，乌贼，荠菜，藕，蘑菇，马兰头，石耳，榧子，柿饼。已经感染的应该吃鳗鱼，文蛤，水蛇，针鱼，鲤鱼，麒麟菜，芹菜，芝麻，荞麦，油菜，香椿，赤豆，绿豆。