巧克力囊肿，腹腔镜手术的做法如下：手术准备完成之后，首先使用二氧化碳气体将患整个腹部膨起。将腹腔镜的器械进入到的腹腔之内，观察一下巧克力囊肿的大小与周围的组织有没有粘连。找到巧克力囊肿位置之后，可以选择使用剪刀和电凝钩。
巧克力囊肿腹腔镜手术之后一般六个月左右才可以准备怀孕，因为在这个时候女性的子宫才能恢复，在准备要孩子的话，会保证胎儿的正常发育，尽量可以避免一些不好的情况出现，所以做了手术治疗之后的女性要好好的调养身体，不能太早要孩子。
巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症的一种，通常手术后三个月后再开始备孕。术后要注意不可以随便服用药物，尤其是激素类的药物，可以多吃些高蛋白高营养的食物，增强体质。平时注意少吃生冷辛辣刺激性的食物，注意腹部保暖，避免身体受风着凉，不要过度劳累和熬夜。
按着临床的要求，在术后恢复期间的这一个月之内，都是要禁止同房的，过早的同房会直接影响到子宫功能的恢复，以及造成生殖器感染，巧克力囊肿是会有存在复发率的。避免着凉的情况，建议禁止辛辣即可的，建议应该用药复查彩超的情况但是吧剧烈活动较好的，平时的情况多食新鲜的水果蔬菜较好的，建议应该营养均衡即可的。
巧克力囊肿手术一般需要一两个小时。手术之前要消毒。手术两三天以后就可以下床活动。术后刀口会有疼痛症状。保持阴部清洁卫生，可以在月经干净后去医院妇科手术，做好术前检查，术后适当休息，不要进行剧烈活动，一个月不要同房，定期复查。注意调养生活的习惯，忌辛辣的食物，发性的食物应少吃比较好的，具体的看看恢复情况。
巧克力囊肿多长时间能治好得看个人的身体情况了。卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变。子宫内膜生长在子宫腔内，受体内女性激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，就会形成异位囊肿。