对于巧克力囊肿能需要治疗多久是要看个人的情况的，每个人的体质不同，时间也就不同。平时要注意自身保暖，经期，禁止激烈体育运动及重体力劳动，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累。情况严重时要手术进行治疗。
一般就是一年到两年左右。中医认为巧克力囊肿主要是由于气血亏虚，湿热邪气结聚所致，一般药物很难治好的。西医主要采取手术治疗，会造成一系列后遗症。中医中药长期临床实践积累了很多非常独特的治疗方法，奇效实用，省钱方便。
巧克力囊肿做的开腹手术，是需要恢复一年才能怀孕的，新鲜的瘢痕在妊娠末期或分娩过程中很容易胀破，而造成腹腔大出血甚至威胁生命。因此，怀孕要在手术一年以后较为安全。期间需要注意饮食的合理性，注意休息好、保持一个良好的心情很重要，确定完全恢复后再怀孕。
这种病情一般的轻度的可以用药物治疗，严重的需要手术治疗。去当地正规三级甲等医院检查，针对病情合理的治疗，会恢复的很快。要饮食清淡，少食辛辣刺激的食物，保证充足的睡眠。
卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种。是具有生长功能的子宫内膜在卵巢生长发育，并且规律性的脱落。腹腔镜术后需要口服药物进行治疗，不然就容易导致复发。如果现在复发了还是采取手术治疗。
巧克力囊肿手术虽然不算大手术，但术后休息一周，是必须的，要完全恢复，可能需要一个多月的时间。注意休息，注意切口卫生，不要熬夜。多吃新鲜的蔬菜和水果，少吃辛辣油腻刺激性的食物。如出现异常情况，及时去医院治疗。