经血逆流，内膜种植。月经期，经血从宫口、阴道排出人体外是顺流而下，但是有小部分经血或因其他原因夹杂着脱落的子宫内膜碎片，由输卵管道流进入腹腔，种植在盆腔脏器的表层形成子宫内膜异位病灶浆膜上皮，化生内膜。人体在胚胎发育时期，卵巢表面上皮、腹膜、阴道直肠膈、脐部均由体腔上皮化生而来，这些组织在性腺激素、炎症、机械因素的刺激下能够转化，形成另一种组织，同样可以化生为子宫内膜。
在月经来潮期间有剧烈的运动，同房，会导致经血逆行导致子宫内膜异位。遗传与体质的因素。临床观察发现，有家族病史的人患此病居多。体质因素中如肥胖、超重、身长过高等亦有多数关系。
大多数都是和个人体质有关系，但是也有一些是和炎症，经期同房，经期剧烈运动，经血逆流，这些情况有一定的关系。内膜细胞本该生长在子宫腔内，但由于子宫腔通过输卵管与盆腔相通，因此使得内膜细胞可经由输卵管进入盆腔异位生长，病因一般有经期同房，剖腹产，妇科疾病等造成。
子宫内膜异位症发病原因不明，主要与下列因素相关：
1、目前认为子宫内膜异位症病因的理论是基于植入理论，也就是经血逆流理论，在怀孕期间，女性在经期的时候，会有一小部分的血液从经脉中流出，然后进入腹腔，再将血液中的活性子宫内膜细胞带到腹腔，然后植入引起炎症的病变。
2、子宫内膜异位与淋巴管的转移密切相关。
3、遗传因子相关。
4、与炎症、免疫等因素相关。
子宫内膜异位症做妇科检查、B超、彩超、CT等检查。
子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，称为子宫内膜异位症，可能与经血逆流、子宫内膜异位种植有关，主要有腹部疼痛、月经异常和不孕症状。子宫内膜异位症做妇科检查、B超、彩超、CT等检查，B超、彩超准确率较高。如果确诊为子宫内膜异位症，建议患者及时就诊，以免导致病情加重。
女性出现慢性骨盆痛、痛经、慢性骨盆疼痛是女性的主要表现，主要表现为下腹深处的腰骶部，也有女性长期慢性下腹疼痛，引起慢性骨盆疼痛。
其次，可能会有性交疼痛，也会有月经不正常的现象，比如月经过多，月经周期延长，甚至会引起不育。出现腹痛、腹泻、便秘等症状也会出现。如果是子宫内膜异位症对输尿管造成的，可能会出现腰痛、血尿、肾积水、肾功能异常等情况。