药物流产对身体伤害是很大的，主要是出血时间长，出血较多，但对子宫内膜的损伤比人流要小。怀孕五十天以内选择药物流产，也可以选择人工流产，人流对子宫内膜损伤大但是出血时间短。
怀孕妇女服用药物流产抗孕药物后，子宫腔内的胎囊组织可在当天排出，有时妊娠组织物排出不全，子宫内膜复原欠佳，阴道出血时间较长。影响以后妊娠，育龄妇女如反复妊娠、反复药物流产，会造成子宫内膜反复受损，由于子宫内膜有损伤，一旦需要正常妊娠，易发生前置胎盘。药物流产可引起产前大出血，甚至发生习惯性流产；。造成女性月经失调。
一般在妊娠49天内可以选择药物流产。但药物流产副作用较大，容易导致流产不全，还需要清宫处理，对子宫损害较大。流产一共分为两种，一种是药物流产，一种是人工流产，药物流产相对于人工流产来讲损伤是比较小的。只要你去正规的医院，听医生的医嘱。一般问题是不大的。
药物流产也是非正常终止妊娠的一种方法，是通过服药或打针达到人工流产的目的。但是相比其他方式，药流对女性身体的危害程度较大。容易引发炎症感染，引起大出血，引发习惯性流产，痛经，药流后有些女性可引发痛经或加重症状，经期下腹部痉挛性疼痛或持续性疼痛，并伴恶心、呕吐、腰酸、乳胀、严重者甚至发生昏厥。药流易导致输卵管堵塞，宫颈粘连，造成不孕。
药物流产适用于怀孕49天以内的，如果患者现在怀孕没有超过49天，做彩超检查可以确诊为宫内孕，可以在医生的指导下服用药物流产药。药物流产药也会有一些副作用，如果肝肾功能不好的是不建议服用药物流产药的，服用药物流产药有可能会流不干净，到时候还需要再做清宫手术。