要看囊肿的大小以及超声检查的性质。生理性卵巢囊肿是由于内分泌失调导致的，并不会引起闭经，不用特殊处理可以自行消失，但是病理性卵巢囊肿会导致卵巢激素分泌异常，容易引起继发性闭经。
卵巢囊肿是可能诱发闭经的。月经不能每月按时来潮，则既要牵涉到子宫发育问题，卵巢囊肿分生理性跟病理性两种，生理性囊肿一般月经之后会自行消失，如果是病理性囊肿，随着时间会有生长的可能。
垂体肿瘤会引起闭经。在产后出现大出血，导致垂体的坏死功能减退造成，不能分泌促性腺激素。卵巢功能由于得不到垂体促性腺激素的分泌的刺激，不会有排卵，子宫内膜由于没有卵泡也，没有雌激素的影响，不会出现子宫内膜增厚或脱落出血，而不会来月经。也不能怀孕，所以出现垂体性闭经，可以使用激素替代治疗，能改善女性更年期的症状。
卵巢囊肿不会引起闭经。巧克力囊肿最明显的症状就是月经来的时候疼的厉害，月经期长，巢囊肿分为两种类型，生理性的卵巢囊肿和病理性的卵巢囊肿。因为每个月经周期，女性卵巢内卵泡都有一个卵泡逐渐的长大，长大成熟以后，这个卵泡就要破裂，破裂以后里边的卵子才能够排出来。生理性的囊肿是卵泡长大后，卵泡无法破裂，卵子无法排出，所以卵子无法与精子结合，不能受孕。但是卵泡内的颗粒细胞是会发生转变的。
子宫囊肿是不会引起闭经的，可以去医院看看，查个血HCG，先排除怀孕，做个B超了解子宫内及盆腔的情况。囊肿大小不等，一般较小而分散。可单独出现，亦可多个出现。可发生于宫颈的任何部位。对生育无明显影响。一般不会引起闭经。月经不来有可能是与怀孕或是激素水平的变化有关的。
一般不会引起闭经，不来月经与体内激素水平有关系，可以先用激素让月经来，来月经的第二至第五天查性激素六项看下月经不调原因。平时注意合理作息，不要熬夜，不要抽烟喝酒。