有性交疼痛，白带增多、色黄或是有异味有的时候也可出现白带夹有血丝的情况，早期症状是痛经，且呈进行性加重，有的也可没有症状，是由于不孕症，去医院检查时才发现的。囊肿到不是很大，是否需要手术治疗，看自己的自身条件。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，应该来说去当地医院检查下，在医生的嘱托下，进行积极治疗，服药期间不吃辛辣刺激的食物，平时多喝水，温水清洗外阴，保持局部清洁，内裤开水消毒，不要有性生活。
巧克力囊肿会出现性交痛，这是最明显的症状，而且常于月经前较为明显，也有少数女性会因巧克力囊肿而引发白带增多、色黄或是有异味，也可能回出现白带夹有血丝等症状，可能去正规的医院检查一下。
卵巢巧克力囊肿的常见症状，性生活痛、这是卵巢巧克力囊肿最明显的症状，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症等均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；白带异常；痛经；即使没有避孕也不会出现怀孕的情况。
巧克力囊肿的症状有痛经，可以在经前、经期、或经后出现，二是月经紊乱，由于巧克力囊肿对于卵巢有破坏作用，造成卵巢不排卵。分泌雌激素的水平也下降，从而导致月经紊乱，不孕不育和腹痛。
卵巢巧克力囊肿早期症状表现有性变疼痛：这也是一个明显的信号，可能还伴有点状流血。不正常的经痛：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆。没有采取避孕措施也不会怀孕。