卵巢子宫内膜异位囊肿治疗要根据年龄、症状、病变程度及对生育要求等情况予以综合考虑。分药物治疗和手术疗两种方法。手术治疗经腹腔镜或B超下卵巢囊肿穿刺抽液及无水酒精囊内注射术方法；经腹腔或腹腔镜行保留生育功能的手术包括卵巢囊肿剥离、成形术，卵巢切除术，病灶电灼术，粘连分解术等；保留卵巢功能的手术切除子宫及盆腔病灶，保留一侧或部分卵巢功能；也可以手术切除全子宫及双附件盆腔。
是一种常见的妇科疾病。卵巢是子宫内膜异位最常见的部位，异位内膜与正常子宫内膜一样，在性激素作用下周期性出血，但是这些血液没有排出的通道，所以聚集起来形成子宫内膜异位囊肿。因为囊内含有陈旧性的巧克力酱样的经血。在行腹腔镜下的卵巢囊肿剥除术。因为卵巢囊肿持续增大，会出现破溃、扭转，出现种植的现象。
子宫内膜异位囊肿可能会影响怀孕的，医院做一个全面的检查，然后针对性的治疗，子宫内膜异位症，是造成不容易怀孕的原因之一，所以应该积极治疗，治疗子宫内膜异位，可以通过药物或者是手术的方法治疗来，建议，药物治疗是通过假孕或者是绝经的疗法治疗，假孕疗法是通过孕激素。
子宫内膜异位症是有生长功能的子宫内膜出现于正常子宫内壁以外的部位，子宫内膜异位症的主要方法就是手术治疗，因为这样的方法可以在直视下可以基本上明确病灶范围和性质，对解除疼痛，促进生育功能效果较好，术后要注意护理，要注意个人的饮食习惯和生活习惯，这样才能让身体尽快的恢复，同时术后，不要急着怀孕等身体完全恢复后再进行怀孕。
子宫内膜异位症手术后，手术后体质虚弱，身体抵抗力下降，术后注意休息，加强营养，多吃富含蛋白质和维生素丰富的食物，有利于身体的恢复和伤口的愈合，少吃生冷，寒凉辛辣，有刺激性的食物。术后一周就可以适当的活动了。术后身体完全恢复正常，大约需要一个月左右。
子宫内膜异位囊肿可以运动，但是，一些相对比较剧烈的运动尽量不要做，以免导致囊肿蒂扭转。日常生活中按时作息，避免过度劳累，注意局部卫生，尤其是例假期间更要多加注意，尽量避免剧烈运动，禁止性生活。