手术治疗：对于下丘脑、垂体肿瘤及卵巢肿瘤引起的闭经，应手术去除肿瘤；含Y染色体的高Gn性闭经，其性腺具恶性潜能，应尽快行性腺切除术；因生殖道畸形经血引流障碍而引起的闭经，应手术矫正使经血流出畅通。
闭经有可能会是内分泌失调或者卵巢早衰引起的，不管是内分泌失调还是卵巢早衰，其治疗方法都是以雌孕激素调理为主，中医治疗为辅！但若能正确面对，注意精神、运动、压力、饮食，配合中西医结合调理会安全渡过此阶段。
有可能与内分泌失调有关，有可能是多囊卵巢综合征等引起的，也不能排除子宫发育异常，去正规的医院做彩超，化验激素六项，甲状腺功能等，查清原因再治疗。如果是多囊卵巢综合征引起的，需要控制饮食，多锻炼。
如不到闭经的时间而发生闭经，是可以治好的，闭经的原因很多，有原发性闭经和继发性闭经，原发性通常是先天性子宫发育不良引起的，继发性闭经的原因也很多，要有子宫性闭经常见的是宫腔术后的宫腔粘连。确诊后对症治疗。
病因治疗，找到引起闭经的器质性疾病给以恰当治疗。例如结核性子宫内膜炎即给抗痨治疗。性激素替代疗法，对先天性卵巢发育不良，或卵巢功能受损或破坏以致早衰者可用激素替代疗法。