男性生殖器流浓且尿痛常见于链球菌性尿道炎。链球菌性尿道炎是很常见的性传播疾病，通过不洁的性接触来传播，致病菌是链球菌。链球菌属于革兰阴性的双球菌，感染人体尿道黏膜引起局部炎症反应，通常起病较急，尿道有脓性分泌物产生。
男性生殖器流浓且尿痛是不洁的性接触感染了淋球菌，支原体，衣原体引起的性传播疾病，肯定需要通过尿道分泌物培养明确到底是什么致病微生物感染引起，然后再选用抗生素治疗。如果只是普通的淋球菌，可以用相关药物针注射治疗一周，支原体衣原体需要口服相关药物治疗两周才能够治好。
男性生殖器尿痛指病人排尿时尿道或伴耻骨上区、会阴部位疼痛。其疼痛程度有轻有重，常为烧灼感，重者痛如刀割。尿痛常见于尿道炎、前列腺炎、前列腺增生、精囊炎、膀胱炎、尿路结石、膀胱结核、肾盂肾炎等。治疗尿痛首先要控制急性感染，同时配合药物外洗。
男性尿痛可能是多种原因导致的，具体分析如下：
前列腺炎，尿道感染，尿道炎等都会引起尿痛。前列腺炎是一种很常见的慢性炎症，与前列腺反复充血，经常同房，自慰等因素有关。尿道是从前列腺内部经过的，前列腺炎症会刺激尿道，导致排尿疼痛。尿路感染、尿道炎等都会导致尿道炎症引起的疼痛。需要去医院做一线腺液和尿检。
尿痛是指排尿时或排尿后耻骨上区或尿道内烧灼样，针刺样痛感，与尿频，尿急合称为膀胱刺激征。病因多见于膀胱，尿道炎症或结石。病变刺激膀胱及尿道粘膜和深层组织，引起膀胱、尿道痉挛及神经性反射。排尿初痛多见于尿道炎，而膀胱炎为排尿中或排尿后痛。注意观察尿道口是否有脓性分泌物。通常需要口服抗生素进行治疗的。