畸形精子的治疗可以采用西医的方法，也可以采用中医的方法，建议采用中西医结合进行治疗，可能会有不错的治疗效果，应该持续进行治疗，尽早到正规的不孕不育专科医院接受检查治疗，以免错过较好的治疗时间。
精子畸形，一般是通过药物来治疗。睾丸疼痛考虑是睾丸炎症，也有可能还是前列腺的问题，应到医院检查后对症治疗。平时要注意少吃辛辣刺激食物、少喝酒、不要久坐，多运动。
精子畸形缓解疼痛要采取综合治疗，养成良好的生活作息习惯、锻炼身体、增强体质，同时还要服用一些对症的药物等，常见影响精子质量的原因有很多，生殖道感染、阴囊温度升高、精索静脉曲张、内分泌紊乱、先天基因缺陷等。
精子畸形也叫畸形精子，是指头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等；体部畸形有体部粗大、折裂、不完整等；尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。因为这高的畸形率，能怀孕的机会渺茫，吃什么药物治疗效果都不会很明显下降，可以在平时生活多锻炼，不要穿紧身的衣物，少吃芹菜、多吃西红柿西兰花。
如果是有精子畸形的情况，一定要重视精子畸形的早期治疗效果，坚持做到早期发现精子畸形的情况，就采取必要的治疗措施，因为早期精子畸形的症状相对来说会比较轻，治疗难度也会比较低。精子畸形的治疗中，要考虑有关药物的控制作用，积极通过查找出病因来展开针对性的治疗。
药物治疗。关键在于精确诊断，查明病因，对症下药。现如今，男性精液不液化原因众多，用药物治疗时要认真对待，规范用药，避免走进就诊误区。物理治疗。作为治疗本病的重要手段，可有先进设备治疗病灶局部。