引起畸形精子的原因比较多。比如泌尿生殖道的感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾炎等；使用激素或某些化学药物；生殖腺长期受到放射线照射；阴囊局部长期高热；长期酗酒等。
局部症状，部分患者会出现性功能障碍等。引起全身不适:出现倦怠乏力、纳食不香、腹胀闷等，时而出现腰膝酸软等症，或伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现。畸形精子是指头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等。
导致精子畸形率高的原因很多，酗酒、吸烟会导致精子畸形，泌尿生殖系统感染，是造成精子畸形的一个主要的原因，内分泌紊乱，化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。
大多数精子畸形病患是由于生活习惯不良以及工作环境引起的。比如平时酗酒、吸烟、泌尿生殖系统感染、内分泌紊乱、化学制剂、环境污染以及辐射等因素都很可能会造成精子畸形的发生。
精子畸形常表现为倦怠乏力，纳食不香，腹胀闷，或腰膝酸软，伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现。有的出现男性不育的相关病症表现。还有一些畸形精子的男性病人有性功能障碍。