衣原体感染不治疗是不会自愈的。
衣原体感染后可能会导致尿道炎、结膜炎等疾病，不及时的处理，会导致症状加重，从而引发炎症。尿道炎是由衣原体感染造成的，如果没有得到有效的处理，就会出现尿痛、尿急、尿频等情况，甚至会导致精囊炎、附睾炎、盆腔炎等疾病。
因此，患者需要及时进行治疗。
衣原体属于非淋菌性感染，可以通过性生活衣物来交叉感染的，而且衣原体是不会自愈的。期间注意好卫生和饮食，衣物和家人分开放洗，避免吃辛辣刺激的食物，用药期间避免同房。
支原体衣原体感染可能会自愈。
衣原体、支原体是临床上两种比较常见的病原微生物，在感染后，患者可能会有自愈的情况，但取决于患者的身体免疫力。如果患者的免疫力很强，可能会自愈，但如果无法自愈，建议患者及时前往正规医院，在医生指导下进行药敏试验，然后选择敏感的抗生素进行抗感染治疗。
肺炎衣原体感染可能会自愈，可能不会自愈。
肺炎衣原体感染是由肺炎衣原体引起的感染性疾病，主要引起成人及青少年的非典型病原体肺炎，如果患者的感染程度较轻，而且患者的机体恢复能力较强，体质较好，则可能会自愈，但是概率较小。反之，则不能自愈。
建议患者及时治疗，以免导致肺部受损。
通常衣原体感染不会自愈。
衣原体的传染性较为，可被分成三类，沙眼衣原体、肺炎衣原体和、鹦鹉热衣原体。因为一般受到衣原体感染不会自愈，所以比如在感染沙眼衣原体后，可在医生指导下使用利福平、金霉素、四环素、红霉素等药物治疗沙眼衣原体所致的眼部疾病。
妇科衣原体感染较自愈。
若是衣原体感染引起了妇科疾病，作为微生物感染，不及时控制治疗，通常会导致病情久治不愈，诱发慢性疾，一般是较难治愈的。患者通常需要及时就医，可在医生指导下使用大环内酯类抗生素药物进行治疗。
用药期间，注意患处卫生，减少病菌滋生。