传染性软疣可以用镊子挤破疣体、涂碘酒，也可以用微波、激光烧灼皮肤、挤出包含物。以上方法均能有效地治疗传染性软疣。其中激光治疗也可去除疣体，特点是单色性、方向性好、相干性强和功率高，但可能会形成瘢痕。治疗后注意护理，一般3-7天后见效，该效果可长期维持。
传染性软疣药物治疗、物理治疗的方式可以除根。
传染性软疣它是较为普遍的病症，可由直接接触或性接触而感染，需去医院就诊，如病毒感染所致，可外涂抗病毒之药，例如，维A酸乳膏。患者还可以用消毒针头刺破顶端，用止血钳把软疣小体挤出，然后外涂抗感染类药膏进行治疗。
阴囊传染性软疣通过外用药物能够除根。
外用药物治疗时，局部药物浓度高，人体的系统吸收小，具有无痛、无创伤、疗效好、副作用小等优点，易于被孩子和父母所接受，但是见效缓慢，需要长期遵医嘱用药治疗。另外，激光、液氮冷冻、电灼等都是可以通过医生指导来进行的，也能达到彻底治愈的效果。
传染性软疣采用冷冻，刮除，药物治疗能除根。
建议病人去正规医院的皮肤科就诊，可采用冷冻，刮除等方式进行处理，此外，还可使用抗病毒药物。对于一些顽固性皮肤病要根据病情选择不同的方案治疗。刮除干净传染性软疣然后涂以碘酊，或者在激光治疗后使用碘伏灭菌。在治疗时应该注意避免食用刺激性的食物。
幼儿传染性软疣可通过直接去除，以及激光或者冷冻的方式进行除根。
幼儿患有感传染性软疣，常与肌肤直接接触有关，对于传染性软疣，最好的办法就是将疣体夹出，也就是在医院进行了消毒，然后用钳子将其捏碎，然后将里面的小疣体挤出，然后进行杀菌，防止感染。其次也可以选择有些可以激光或者冷冻的方式进行去除。
儿童传染性软疣需要用医用刮匙直接刮除或用金属镊子直接拔除。也可以用消毒针刺破疣体的顶端，挤出里面的内容物，里面可能含有大量的软疣小体，这是传染性软疣传播的主要途径。
传染性软疣主要是由于免疫机能下降，特别是皮肤屏障功能下降，导致这种病毒定植感染，感染后会形成疣状增生，最终形成传染性软疣。