如果是男性支原体，可以进行尿液培养，以确定其是否有抗菌活性，从而进行药物治疗。
阿奇霉素是男性支原体感染的首选药物，在用药过程中要注意不能有性生活，以免交叉感染等，最好是性伙伴一起进行。多饮水，保持生殖器官的清洁，每日更换贴身衣服，并用温水冲洗。
孩子支原体感染要吃红霉素、阿奇霉素等药。
对于年龄较小的孩子，可以选择应用红霉素，而阿奇霉素适用于稍微年长一点的孩子。阿奇霉素相对于其它类的大环内酯类抗生素，疗效更好，更持久。并且对于孩子支原体感染的治疗，在应用大环内酯类抗生素，必须在医生的指导下严格控制用量。
支原体肺炎、急性支气管炎、支原体肺炎等是支原体感染引起的咳嗽，常用的抗菌药物有盐酸二氧丙嗪、右美沙芬等。
支原体感染以干咳为主，当咳嗽明显时可给予盐酸二氧丙嗪、右美沙芬等镇咳药物。部分抗菌药物对妊娠、哺乳期妇女和18岁以下儿童禁用。
如果需要用药，一定要到医院明确诊断，然后在医生的处方下服用。
女性支原体感染一般要吃抗生素。
支原体感染是指支原体侵入机体，引起的呼吸道、泌尿生殖系统、皮肤黏膜、血液系统等感染。如果女性出现支原体感染，通常要遵医嘱使用抗生素进行治疗。可以遵医嘱吃多西环素、左氧氟沙星等抗生素抗支原体。
日常要杜绝不洁性行为。
肺部支原体感染要吃大环内脂类药。
支原体肺炎主要表现为咳嗽、肢体乏力、肌肉酸痛等，可呈零星分布，多见于5-15岁的孩童。支原体肺炎是一种自限性的疾病，但如果病情比较严重，建议患者可以在医生的指导下使用大环内酯类药物进行治疗。包括阿奇霉素片、红霉素胶囊等。
解脲支原体感染要吃盐酸米诺环素、盐酸多西环素、霉素肠溶片、左氧氟沙星片等药。
盐酸米诺环素：对各种具有抗菌作用的解脲类支原体均有显著疗效；盐酸多西环素：具有很好的抗支原体和衣原体的作用，但对肠胃有一定的刺激性作用，应在餐后使用；红霉素肠溶片：肠溶片在肠内被消化，不会引起肠胃的不适，对解脲支原体的感染有很好的疗效；左氧氟沙星片：是一种喹诺酮类的药物，具有很好的抑制和杀灭各种解脲支原体的效果。