在巴氏腺囊肿初期，可以服用一些抗感染的药物，比如头孢克肟分散片、头孢克肟咀嚼片等，可以配合甲硝唑进行抗感染。还可以配合局部坐浴，或者是服用一些清热解毒的中药来治疗。巴氏腺囊肿在服用药物的过程中，要注意观察，如果没有明显的改善，导致局部肿胀、疼痛、行走困难，甚至出现了不稳定的症状，这种情况下不能再服用药物。必须通过外科手术切开引流，否则会导致持续的疼痛，从而影响到工作和学习。
一般来说，巴氏腺囊肿可以吃头孢地尼、奥硝唑胶囊、阿奇霉素等药物，具体如下：
巴氏腺囊肿又称前庭大腺囊肿，是因前庭大腺的腺管开口部阻塞，分泌物积聚于腺腔而形成。囊肿小且无感染时，一般没有症状，如果囊肿较大，可有外阴坠胀感或性交不适。通常可采用头孢地尼、奥硝唑胶囊、阿奇霉素抗生素进行治疗。
在治疗期间，应保证营养均衡，饮食以清淡为主，多吃新鲜的水果和蔬菜，多喝水，多吃富含蛋白质的食物，平时要少吃油腻煎炸、生冷食物。
一般情况下，所谓的巴氏腺囊肿，是由于细菌、病毒等特殊病原体感染了外阴，引起了炎症，从而造成了腺管的开口处阻塞，从而造成了腺体的分泌物无法排泄而形成的囊肿。其主要表现为外阴后下1/3部位肿胀，局部肿胀，不能正常走路，会严重影响工作和生活。局部麻醉、前庭大腺囊肿造口术后3-5日即可出院，通常术后1-2周后即可痊愈。
一般情况下，巴氏腺囊肿又称前庭大腺囊肿，通常能好，但是需要积极进行治疗。具体情况分析如下：
称前庭大腺囊肿发生在女性大阴唇与小阴唇的交接部位，因生理或病理因素造成的腺管堵塞，使囊腔内液体无法排泄而形成的囊状肿瘤。对于此症，可以通过外科和药物的方式来进行。可以选择激光造口术，同时要做好清洗、换衣服、防止感染等。若出现脓性感染，应做切口引流术。可以口服一些中药，同时还可以使用大黄牡丹汤、金银花、紫花地丁、丹皮、赤芍等进行消肿止痛的方法。
巴氏腺囊肿（亦称巴多林腺）又称前庭大腺囊肿，前庭大腺位于两侧大阴唇后部，腺体开口于小阴唇内侧近处女膜处。前庭大腺分泌液排出受阻而积聚于管腔，引起腺体囊性扩张，就会引起巴氏腺囊肿。主要症状为一侧阴唇较另一侧肿大，由于巴氏腺囊肿可以长期存在，多年不变，如果不妨碍日常生活，则可以定期观察，无需治疗。
巴氏腺囊肿一般指前庭大腺囊肿，可以通过手术、使用药物等方法进行治疗。
前庭大腺囊肿是因前庭大腺管阻塞，分泌物积聚而成，而腺管堵塞，分泌物不能排出，脓液会逐渐转为清液而形成囊肿，腺腔内的黏液浓稠或先天性腺管狭窄排液不畅，也可形成囊肿。通常可以通过手术进行治疗，比如前庭大腺囊肿造口术，而为了消肿，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有服左氧氟沙星、阿奇霉素、头孢克肟片等。