一般来说，月经干净两天后同房又出血可能是月经没排干净、宫颈病变等因素导致的。具体分析如下：
月经期结束后在阴道内和宫腔都存有少量未排出的积血，同房时可能会导致积血排出，出现月经干净两天后同房又出血的情况。如果经常出现月经干净两天后同房又出血的情况，考虑有可能是宫颈病变。近期建议暂时不要同房，期间观察出血量与持续的时间。建议患者及时前往医院查明病因后对症治疗，以免延误病情，影响身体健康。
一般情况下，月经干净3天后同房出现出血现象，首先考虑性生活不当引起的月经回潮，也可能是妇科炎症引起的，具体内容如下：
月经干净3天后同房会使子宫受到过度刺激，从而可能引起月经回潮，这种情况下，患者平时应该注意性生活卫生，房事前应该清洗局部，避免同房；月经干净3天后同房出现出血现象也可能是妇科炎症引起，如子宫内膜炎、宫颈癌等，应该考虑接触性出血，建议患者及时到医院妇科做阴道镜检查或者做子宫B超检查，查明病因后对症治疗。
女性在月经没有干净的时候，同房又出血，考虑是月经血没有流出干净，所以才导致在同房的时候，将月经血排出阴道。女性来月经的时候，阴道口和宫颈口都处于开放状态，而且这一期间宫腔内膜剥落，同房很容易刺激子宫收缩，促进经血流出。同时，月经没干净就同房，容易继发感染，引起子宫内膜炎，而且在同房的时候还可能会导致少量剥落的内膜，随着输卵管的蠕动游走到输卵管内，从而引起卵巢巧克力囊肿。因此，不建议女性在月经没干净的时候同房。
月经没干净同房又出血，有可能是正常的月经血，因为月经血没有干净，即使不同房，也有可能出现阴道出血。月经期的女性是禁止性生活的，因为女性在月经期间，宫颈口是处于微微张开的状态，如果此期间同房，特别容易引起子宫内膜炎症、盆腔炎症、盆腔感染。另外，同房时由于性生活导致少量子宫内膜脱落，也会出现阴道的出血。
一般来说，引起月经干净两天后又流血的主要原因是以下这些：
1.如果体内的雌性激素不足，子宫内膜就会因为缺乏雌激素而再次出现阴道出血。
2.子宫内膜的炎症会引起子宫内膜的异常脱落，这是因为内膜炎症引起的组织比较脆，从而引起阴道出血。
3.阴道不规则出血的原因也可能是患有子宫内膜异位症、粘膜下子宫肌瘤等造成的。建议患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
月经干净两天同房又出血考虑是子宫内膜并没有完全恢复，还可能是妇科疾病造成的。
如果出现月经干净两天同房又出血的情况，可能是因为这时子宫内膜没有完全恢复，同房时可能会刺激子宫内膜，导致出血，建议女性先观察一段时间，如果出血较多，应及时就诊。如果是宫颈癌、子宫肌瘤等引起的月经干净两天同房又出血，女性应及前往医院诊治，避免延误病情。