怀孕早期肚子疼腰疼可能是宫外孕或流产。
如果孕早期有比较严重的肚子疼痛、腰痛需要尽快去医院检查，是否是宫外孕导致的。如果不是，可能是孕酮低导致有流产前兆，需要中西药结合保胎治疗，如滋肾育胎丸，既补肾又安胎，能治疗孕期腰痛症状。
建议孕妇在日常生活中吃含有蛋白质的食物，多吃新鲜的蔬菜水果，饮食清淡，禁烟禁酒，注重休息，保持愉悦心情。远离刺激性气味，室内要定期开窗保证空气流通，定期产检。
一般情况下，怀孕40天肚子疼、腰疼可能会有湿疣或者是妇科炎症等病症导致的，但如果患者伴出现阴道出血的情况，可能会导致流产、异位妊娠等，因此孕妇需要到妇产科做一下子宫超声波，通过血液孕酮检测确定是否存在此病症，然后进行相应的治疗，日常生活中要多休息，不要做激烈的运动，不要对孕妇的肚子产生撞击、挤压等刺激，以免加重。
怀孕两个月腰疼、肚子疼可考虑是否出现了先兆流产的情况。
妊娠2个月后腰部疼痛腹部疼痛，首先要注意阴道有没有红色，可能是因为有预兆的流产，或者是由于子宫收缩引起的，需要做B超，观察孕囊的生长状况，如果孕囊发育的很好，可在医生指导下使用黄体酮胶囊保胎灵，并在床上静养，一般10多天后再来做保胎治疗。B超显示孕囊发育不良，可以停止保胎，并建议停止妊娠。
怀孕初期肚子疼腰疼，有可能是正常情况，也有可能是异常妊娠或其他疾病导致。
1.正常情况:在怀孕的初期，受精卵着床可能会导致子宫收缩，引起肚子疼腰疼。另外胚胎生长发育也有可能会出现这种情况，属于正常情况。
2.异常妊娠。在怀孕初期，如果发生先兆流产，宫外孕等异常妊娠，均有可能会因为子宫收缩而发生肚子疼腰疼，需要去医院做B超和血HCG化验来诊断。
3.其他疾病：如果发生肠炎、泌尿系感染、结石等疾病，也会出现腰疼和肚子疼的情况。
孕妇在怀孕初期会出现腰痛、肚子疼的情况，主要是因为怀孕初期不习惯，或者是精神紧张，或者是盆腔充血、子宫变大，或者是相邻的组织受到了刺激。
一般来说，休息后通常是可以减轻的。如果有明显的疼痛或异常的出血，需要考虑是否存在妊娠后的先兆流产和宫外孕。需要到医院检查，确诊后再进行治疗。孕期注意饮食健康，规律作息。
一般情况下，怀孕两个月肚子疼腰疼，可能是先兆流产、盆腔炎症、腰椎问题、腰部肌肉劳损、便秘、腹泻、尿路感染、肾脏问题等原因引起的。建议及时到医院妇产科进行检查，寻找疼痛原因，然后根据疼痛原因给予治疗。
正常孕期不应该出现肚子腰部疼痛，如果出现异常，需要及时就医。
平时可以适当活动，尽量避免长期卧床休息，不要吃生冷、辛辣等食物。