宫颈糜烂微波手术危害是可能会出现宫颈管的机能损害，出现宫颈管粘连。
宫颈糜烂微波治疗是用微波对组织的热效应使蛋白凝固，以得到凝血、止血的目的。局部加热使得血流加速，增强代谢，促使组织再生等。因为微波是利用热效应，因此治疗过程中易造成宫颈局部过度灼烧，组织挛缩，形成瘢痕，组织挛缩形成瘢痕，造成宫颈分泌物减少、性欲降低，或导致宫颈分泌腺闭锁，继而造成不孕，宫颈瘢痕组织形成，在分娩过程中造成分娩时宫颈扩张异常，造成产程延长或产程停滞，宫颈瘢痕弹性减低，在分娩过程中也易造成宫颈撕裂、出血等可能增加。
建议：平时注意多休息，注意会阴部卫生，可以每晚用温水清洗外阴，定期到医院进行复查。
宫颈糜烂做微波可能会影响以后的生育。
宫颈糜烂微波治疗以后会导致宫颈局部解剖轻微发生变化，使局部弹性降低，也会造成不孕，一般对于宫颈糜烂这种正常的生理现象，临床上不用给予治疗。只要是每年做1次妇科检查，并且做宫颈癌的筛查就可以了。
建议患者及时的到医院进行诊断，在医生的指导下进行对症的治疗，平时的饮食中要少吃辛辣刺激的食物。
微波治疗也是有一定的副作用的，因治疗过深易造成宫颈局部组织挛缩，瘢痕形成，性生活时不敏感，宫颈分泌物减少，甚至性欲低下或导致宫颈分泌腺闭锁，使宫颈黏液发生改变而不孕，或造成分娩时宫颈扩张障碍，分娩困难等情况。选择适合的宫颈糜烂检查项目，才能够保证得到正确的诊断，实现积极的治疗。
微波宫颈糜烂手术是不会疼。但是对于特殊的人群，绝经后的女性、对疼痛耐受力比较差等，有可能出现治疗时疼痛的发生。宫颈糜烂是正常的生理现象，属于宫颈的柱状上皮异位，如果查宫颈的tct，HPV没有问题，就不用宫颈微波治疗。
宫颈糜烂微波手术之后2个月禁止同房，避免逆行感染，一般在8周如果保养好的话就可痊愈。手术后注意休息，不要劳累，注意个人卫生，勤换内裤，不得混洗，穿纯棉制品宽松内裤，经常用开水烫洗消毒内裤，少吃辛辣刺激性食物忌酒烟等，2个月禁止同房。
住院观察进行微波调理即可，每天一般是15到30分钟，就是进行红光照射等，看一下是否分泌物多或者伴随排液等情况，治疗期间避免性生活，注意外阴的清洗消毒，内裤暴晒即可，不要吃生冷刺激的食物，多吃营养健康的食物多吃水果蔬菜多喝水。