肾囊肿是否会引起腰疼，要看囊肿的部位、大小和数量。囊肿直径小于五厘米的情况不会有任何感觉和不适。若囊肿直径比较大，会产生疼痛，如是合并感染，会因为感染出现发热胀痛的情况。
大部分病人在平时的确会出现腰酸腰疼的问题，这是因为囊肿压迫了卵巢，从而使病人出现的一种症状表现。卵巢囊肿是女性的疾病的影响是产生水肿、皮肤水肿对女性的身体有很大的影响，之后也患有卵巢囊肿会导致女性食欲，减肥，腹胀，女性还会引起呕吐、发烧、腹痛等症状，然后发展可引起严重的水肿。
肾囊肿是成年人肾脏最常见的一种结构异常，单纯肾囊肿一般没有症状，只有当囊肿压迫引起血管闭塞或尿路梗阻时可出现相应表现，有可能对肾功能产生影响。囊肿体积较小，但是有腰痛症状，建议去医院复查一下，如果体积增大，可以囊液抽吸术并囊内注射硬化剂或行手术治疗，没有特别有效的药物对于肾内囊肿治疗。
前列腺的囊肿有明显增大时，会压迫后尿道、膀胱以及输尿管末端，引起尿道狭窄，排尿困难。还会挤压临近的腰部的组织，导致腰部充血水肿，疼痛加重，甚至放射到腰骶部、髋部，会阴部等。
卵巢囊肿是有可能引起腰痛的，也有可能腰痛是卵巢囊肿的主要症状。出现腰痛要及时治疗，也可以复查一下囊肿的情况，同时还要警惕是否有其他妇科炎症，或是腰肌劳损等引起的腰酸痛。
应该再对其右肾的部位进行检查一下，看看是其右肾有这样的病症没有，如果其腰痛的症状是与肾囊肿有关，那就是通过手术的办法将其肾囊肿进行摘除，就可以了。如果右肾发现有疼痛的感觉了，那就是有可能是其右肾也发生囊肿的病症了。