肾结石疼痛在医学上被分为是11级疼痛，是内脏疼痛。医学上最严重的疼痛分级是12级，就是母亲的分娩痛。内脏疼痛仅次于分娩痛。肾结石的疼痛一般都是因为结石排泄过程中导致输尿管痉挛，肾脏积水，疼痛呈阵发性绞痛，疼痛向下腹部膀胱区及后腰部放散，同时有血尿，还伴有恶心呕吐胃内容物。患者因疼痛辗转反侧，痛不欲生。
通常情况下，肾结石更容易引起患者的疼痛，尤其是腰腿疼痛。
肾结石有疼痛一般情况下都属于正常现象。患者有疼痛，应该及时去医院检查，同时也应该接受正规治疗。肾结石发病初期，若是形成急性梗阻的话，那么就会引起腰部疼痛较为剧烈，要及时去医院做详细检查，以明确结石具体病情，之后再对症治疗一些。如解除输尿管痉挛止痛药物等对症处理，此痛可有减轻。与此同时，对于肾结石也要积极的治疗，只有把肾结石完全的排干净了，这样的痛苦才能得到完全的治愈。
如果有肾结石是表现为腰部的酸胀不适，而且腹部会有隐痛，如果活动或者是走动可能疼痛会发作或者加剧，严重患者会脸色惨白，而且同时会出冷汗，严重可能会有休克的状态，同时还会有恶心呕吐和腹胀便秘的症状，而且还会有排泄功能的故障。
肾结石的疼痛部位常位于脊肋角、腰部和腹部，多数呈阵发性，也可为持续性疼痛，肾绞痛常见于结石活动并引起输尿管梗阻，输尿管绞痛的特点是一侧腰痛，剧烈难忍，可放射到下腹部、睾丸或阴唇。
肾结石的疼痛没有分级，对于比较大的肾结石一般疼痛很轻，其主要会卡在肾盏或者肾盂内，没有移动，所以疼痛主要表现腰背部有胀痛，肾脏积水后腰背部胀痛比较明显。如果病人是小的结石，处于活动期，由肾盏排到肾盂或者由肾盂排到输尿管，在过程中会引起剧烈的绞榨样疼痛，疼痛非常剧烈。