怀孕期间可以进行核磁共振检查，因为孕妇有肥胖、羊水不足、胎儿已经进入盆内，或者是产前超声无法确认的情况。
可以为胎儿胃肠道和消化道的异常情况提供更多的补充资料。建议孕妇和家人不要害怕核磁共振会产生辐射，也不要担心会对胎儿的发育有什么影响。在怀孕的3个月内，胎儿正处在细胞的分化发育阶段，因此要避免做核磁共振。
女性月经期间是可以做核磁共振的。
核磁共振没有放射性,检查前确定身上没有金属类物品,避免导致危险。经期做核磁共振提前跟医生沟通,若带有节育环不建议做核磁共振,因为节育环是金属类的。做核磁共振不会影响身体,部分患者会因封闭的空间导致幽闭空间恐惧综合症,感觉窒息、呼吸急促,这类症状极少见,女性经期做核磁共振没有多大影响。经期注意饮食,保持生活规律,女性经期身体虚弱,要多休息，饮食要清淡为主,不吃辛辣、刺激的食物,注意经期间护理，避免导致月经不调等情况。若是经期做检查,建议先跟医生沟通，了解注意事项,避免检查对患者带来不的影响。
口内有金属假牙不可以做核磁共振。在做磁共振检查时，身上不能有金属物品，包括金属假牙。特别是在进行头部磁共振检查时，口中的金属假牙会影响磁场的均匀分布，使得图像不清晰而影响诊断。如果是活动性金属假牙，在做磁共振检查时，磁共振产生的强大磁力会使假牙发生移位，进入体内可能会对人身体造成意外伤害。此外，金属假牙还可能会在强大的磁场作用下被吸入机器内而毁坏机器。
一般情况下，骨折可以进行核磁共振检查，前提是没有植入心脏起搏器和任何的金属材料，具体内容如下：
核磁共振检查会造成一定的风险，而且大部分的骨折都可以通过X光片来确诊。对于部分骨折，有一定的诊断难度，当要确定骨折的位置时，可以进行Ct扫描。除非是一些特别的病例，例如脊柱骨折，通常要通过核磁共振来确定椎管中有没有骨块占据，或者是硬膜囊被挤压。所以，对于有骨折的病人来说，骨折可以进行核磁共振检查。
核磁共振对颈椎病没有用，核磁共振是临床医学辅助诊断检查的方式之一。核磁共振的原理是通过先进的医疗技术采集并对比分析，电磁信号经过人体各个组织器官后的变化，并以图像的形式显示出来。
磁共振是完全可以进行全身各个部位检查的，比如头颅，心肺，腹部和四肢关节等方面，例如CT可以发现脑外伤、脑出血、脑肿瘤、异常血管、脑萎缩等，可以检查胸壁、肺部以及纵隔的病变，对于肝脏占位性病变，以及全身骨骼病变都较其它的影像学检查方法更具有较大的优势。