乙肝小三阳的转阴主要指的是乙肝病毒定量的转阴。乙肝小三阳病情的进展，发生肝硬化、肝癌的危险因素，主要来自于乙肝病毒的复制。所以乙肝小三阳的转阴，首先应该将病毒定量转为阴性，可以选择口服药物，可以在短期内将病毒转阴，肝功能恢复到正常。
如果处于肝炎活动期，应该进行积极的治疗，经过抗病毒、保肝、护肝等综合性的治疗，肝功能可以转为正常，病毒转为阴性。目前对于抗病毒治疗的应用，可以很简单的使病毒转为阴性。
所谓乙肝小三阳自然转阴，就是指不使用任何药物治疗，依靠感染者自身的免疫功能将乙肝小三阳转阴。不管是乙肝小三阳还是乙肝大三阳转阴的机率都是很小的。当然自然转阴也有可能。不过这样的状况很少见。
大部分的乙肝小三阳病人都难以转阴，只有一小部分可以转阴。
乙肝小三阳是乙肝表面抗原阳性、乙肝E抗体阳性、乙肝核心抗体阳性，是乙肝病毒的免疫学指标。乙肝小三阳患者的病情很难转阴，这是由于乙肝病毒感染后，人体会长时间携带病毒，如果不及时治疗，几乎不会出现转阴。
建议患者选择适合自己的方式治疗，定期复查。
肝病小三阳可以让病毒转归阴性，肝脏功能也会回归到正常状态。
经过有效的抗菌药物，可以将体内的病毒彻底排出，使肝脏的功能达到了最佳状态。在这个情况下，一部分的小三阳可以实现表面抗体的转阴，即达到了临床上的治愈，但还是有一些病人能够得到很好的治疗。乙肝小三阳要及时的进行规范的治疗，避免出现慢性肝炎，避免出现终末性肝病。在进行药物治疗的同时，要做到饮食均衡，并要定时进行检查。