这需要按照病情分为非手术治疗和手术治疗。轻度脑积水应先试用非手术治疗，以脱水疗法和全身支持疗法为主。手术治疗适用于脑室内压力较高或经非手术治疗失败的病例。严重脑积水如头围超过50厘米、大脑皮质萎缩厚度在1厘米以下，已合并有严重功能障碍及畸形者，手术疗效不佳。
脑室穿刺引流手术主要就是将颅内多余的脑积液引出，可以缓解颅内的压力，防止造成脑疝。对于慢性脑积水，可以做脑室腹腔分流手术，这是目前最常见的分流手术的形式，当然也有其它的手术方式包括脑室心房引流术，脑室骶尾腔引流术，但是目前其它手术方式并发症比较多，相对较难实施。
任何一场手术都是有一定的手术风险的，只是风险大与小的问题，而先天性脑积水的手术方式多采用脑脊液分流术。一般成功率是比较高的，但是术后要注意防止发生并发症，如凝血块阻塞导管，心脏内血栓形成，心内膜炎，败血症等，所以不必太过担心，并没有想象中的恐怖。
怀孕36周脑积水需要根据胎儿的情况进行具体判断。
脑积水是因为胎儿的脑室系统从某一部位阻塞所致，导致脑室扩张积水，从而压迫正常脑组织。其病因复杂，临床上主要以颅内占位病变和先天性畸形为主。妊娠36周时脑室宽正常者为1厘米以上，在一到1.5厘米之间，应进行核磁共振，明确诊断1.5厘米后证实为脑积水。另外还要考虑妊娠时间过长是否会造成胎儿缺氧和颅内感染等情况。畸形的诊断推荐羊水穿刺，如确属畸形推荐引产。
通常情况下，可通过B超、X线片来判断宝宝脑积水。具体情况分析如下：
宝宝有没有脑积水要从胎儿期就可以做出判断，在胎儿期可以通过B超检查，观察侧脑室有没有分离，从而判断是否有脑积水。宝宝有没有脑积水，还可以做一些医学检查。可以进行头颅透光试验、头颅超声波检查、颅骨X线片等检查，如果发现婴儿头部全透光，出现脑室波增大，颅腔增大，头部比例不对称等，可以诊断为脑积水。
